Улитка 2108 на ниву: Установка вентилятора отопителя от ВАЗ 2108 на Ниву
Установка печки ВАЗ 2108 на Ниву: схема, видеоинструкция
Переделка штатной печки на Ниве поможет вам предотвратить множество проблем в будущем, когда начнутся устойчивые морозы. Главной проблемой отопительной системы этого автомобиля является то, что зимой салон практически не отапливается. Самостоятельная установка деталей печки ВАЗ-2108 на Ниву поможет персонализировать этот агрегат и сделать его работу более эффективным. Опытные автолюбители рекомендуют ставить на Ниву 4×4 лишь часть запасных частей от печки, чтобы не проводить более глобальные работы.
Читайте также:Самостоятельная замена крана печки ВАЗ-2109 высокая и низкая панель
Доработка печки: инструкция
Чтобы доработанный агрегат работал более эффективно, необходимо установить на него качественные запасные части. Делается это следующим образом:
Читайте также: Как делается замена радиатора печки Лада Калина
- Под новый отопитель от ВАЗ-2108 вырезается посадочное место. Делайте это аккуратно, чтобы оно проваливалось или находилось выше воздуховодов. При этом двигатель должен располагаться так, чтобы он не упирался в капот, то есть как можно ниже. В противном случае, вентилятор его выйдет из строя очень быстро.
- Через выходное отверстие в воздуховоде плавно выведите питание двигателя.
- Уплотните места крепления отопителя герметиком. Не пропустите ни одного крепежа, иначе во время работы двигателя от вибрации питание двигателя будет нарушено.
- Две пластины из нержавеющей стали вырежьте под размеры сопла и верхнего проема. Несколько раз отмерьте, прежде чем разрезать сталь.
- Кран(заслонку) снимите при помощи гаечного ключа и отвертки. Делайте работу аккуратно, чтобы вам не пришлось покупать новую печку.
- Завершите работу установкой новых воздуховодов и сборкой системы.
Не стоит устанавливать дополнительный отопительный агрегат на вашу Ниву, она не даст много тепла, но повысить нагрузку на двигатель. Рекомендуется после завершения монтажа проверить деталь на нескольких режимах. Если нет вибрации и шума, то можно пользоваться обновленной печкой без ограничений.
Читайте также:Как правильно разобрать печку на ВАЗ-2107
Рекомендации специалистов по доработке печки деталями ВАЗ
Установку деталей от ВАЗ стоит производить при соблюдении правил:
- Необходимо посадочное гнездо под новую деталь сделать на 2 сантиметра больше, чтобы снизить вибрационную нагрузку.
- Установка крана должна производиться с учетом специфики отеплителя ВАЗ. В этом случае проблем, с этой деталью будет меньше.
Если во время демонтажа старой печки вы заметили, что она имеет значительный износ, то лучше всего заменить агрегат полностью. У целой с виду «улитки» необходимо менять только двигатель. Разбирайте корпус аккуратно, чтобы не повредить его. Замена мотора отопителя – наиболее приемлемая по затратам времени процедура. Вам не нужно будет подгонять корпус печки под размеры «улитки».
Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Нива печка 2108 | VAZ 21213 VAZ 2131 ВАЗ 21214 тихая печка Нива с вентилятором 2108
Обновлено:
Нива-печка салонный фильтр и мотор вентилятора 2108 легко установить своими руками в автомобиль Нива ВАЗ 2121 21213 21214 2131 LADA 4×4 URBAN 21215, 21219, Нива-Бронто, 2129, 21310, Нива-пикап, 21214-М, ЛАДА 4х4 УРБАН.
Добро пожаловать на наш сайт НИВА ПЕЧКА. Если вы здесь, значит у вас есть автомобиль Нива . И значит у вас есть вопросы по вентиляции и обогреву в салоне Нивы. Если вы еще не переоборудовали штатный отопитель в Ниве, то наш сайт поможет вам в этом деле. Когда-то любой владелец Нивы задается вопросом — что делать со штаным вентилятором отопителя? Вентилятор отопителя шумит, у него низкая производительность, к нему неудобно добираться для его ремонта, всего две скорости, в мороз из-за плохой вентиляции окна в салоне Нивы затягивает инеем. И эти недостатки присутствуют на любой модели Нива 2121 21213 21214 2129 2131. В том числе и на современных ЛАДА 4х4 УРБАН, LADA 4×4 URBAN. Причем независимо от года выпуска и варианта исполнения, будь то карбюраторная Нива или инжекторная Нива.Однако не у всех есть время для таких экспериментов, работа и домашние заботы могут запросто отбить желание переделывать печку в Ниве. Несмотря на кажущуюся дешевизну самостоятельной переделки вентилятора отопителя в Ниве, личное время потраченное на переделку печки может свести на нет всю экономию. Но самое обидное, когда начав переделку печки в Ниве, по разным причинам (кому-то надо просить сварку, кому-то искать электрика, чтоб подключить вентилятор) дело затягивается, деньги потрачены, печка в Ниве еще не переделана, а зима приходит неожиданно! В нашей команде у всех есть автомобиль Нива, и мы знаем эту проблему непонаслышке. Поэтому мы предлагаем для переделки печки на Ниве различные комплекты, выверенные по размеру и готовые для установки как на карбюраторные так и на инжекторные Нивы. Комплекты Нива печка для установки вентилятора 2108 в Ниву самые разнообразные по составу. От самого полного комплекта (окрашенный корпус воздухозаборника для крепления вентилятора 2108, реостат, переключатель скорости, ручки, болты, уплотнители, улитка 2108, усиленный электрический жгут для подключения в штатную проводку без ее повреждения) до любого элемента по отдельности. Вы сами можете выбрать какие элементы у вас уже есть, а какие вам нужно приобрести. А съэкономленное время это по сути съэкономленные деньги. И поверьте, какой-бы способ переделки печки на вашей Ниве вы бы ни выбрали, когда вы завершите переделку, готовый результат доставит вам только положительные эмоции! И вы полюбите свою Ниву еще больше.
Успехов вам, с уважением команда сайта nivapechka.com.
Владельцам автомобиля Нива посвящается!
Легендарный советский внедорожник ВАЗ 2121 Нива, а теперь и российский ЛАДА 4х4 любим многими поколениями россиян. Нива пользуется заслуженной популярностью и за рубежом, за свою неприхотливость и непревзойдённые вездеходные качества. Я также являюсь поклонником автомобиля Нива. Много лет эксплуатирую ВАЗ 2131 Нива. Но как в далёком в 1977 году, так и в настоящем 2013 году автомобили Нива имеют моторчик печки с лопастной конструкцией, который шумит, визжит и не справляется с вентиляцией салона. читать дальше…Что до сих пор является ложкой дёгтя в автомобиле Нива. Это заставило меня взяться за поиск решения проблемы. Так как я живу в Сибири и 6 месяцев в году у нас зима и регулярно бывают морозы -300С и -400С, со штатным вентилятором окна регулярно приходится отскрёбывать от инея. А если едешь в -300С по трассе, ещё и лобовик затягивает. Отказываться от автомобиля Нива из-за плохой печки не было желания. Стал искать решение вопроса. Первое, что пришло на ум использовать вентилятор печки ВАЗ 2108 (высокая производительность, тихая работа, доступная цена, достаточно высокий ресурс). Различные эксперименты с установкой вентилятора укрепили мысль установить его в подкапотном пространстве. Для этого потребовалась серьёзная модификация штатного воздухозаборника. Путём подрезания и перепаивания воздухозаборника была получена необходимая конструкция. Практические испытания показали её высокую эффективность. Как оказалось, в своих изысканиях был не одинок и на просторах интернета я натолкнулся на аналогичную конструкцию уважаемого Cмогилa. Его конструкция была похожа на мою, но отличалась тем, что состояла из двух частей. Благодаря этим идеям я изготовил свою модернизированную печку из металла и из двух частей для своего автомобиля, которой очень доволен. В результате чего она стала практичней и значительно удобней в эксплуатации. А вентиляция салона в Ниве стала выше всяких похвал. Рекомендую такую печку всем Ниваводам.
Декабрь 2021
Поздравляем с наступающим Новым 2022 Годом!
Поздравляем всех с наступающим Новым 2022 годом! Желаем всем здоровья, счастья и Новогоднего настроения! Пусть все плохое (и короновирус) останется в прошлом, а в новом будет только хорошее! Не болейте, берегите себя и своих близких! С наилучшими пожеланиями команда сайта nivapechka.com Декабрь 2020
Поздравляем с наступающим Новым 2021 Годом!
Поздравляем всех с наступающим Новым 2021 годом! Желаем всем здоровья, счастья и Новогоднего настроения! Пусть все плохое останется в этом году, а в новом будет только хорошее! Берегите себя и своих близких! С наилучшими пожеланиями команда сайта nivapechka.com Ноябрь 2020
Надежда на вакцину от SARS-CoV-2!
Сразу несколько фармацевтических гигантов сообщили о своих промежуточных успехах в создании вакцины от COVID-19. Так же они сообщают о возможном скором запуске их промышленного производства. Это очень хорошие и обнадеживающие новости! С наилучшими пожеланиями команда сайта nivapechka.com Январь 2020 Январь 2019 29.11.2018 26.06.2018 29.12.2017
C наступающим Новым 2018 Годом!!!
12.04.2017 12.04.2017
Наша легендарная «Нива» отмечает юбилей!
Прошло 40 лет с тех пор как с Волжского автомобильного завода вышла первая серийная «Нива». Автомобиль завоевал уважение поклонников со всех континентов и стал родоначальником класса SUV (Sport Utility Vehicle).
По прошествии 40 лет с момента выхода первого серийного автомобиля «Нива» изменилась несильно. В девяностых годах руководство умудрились передать имя «НИВА» совместному предприятию с General Motors. Новое имя «Lada 4×4» не популярно, и народ называет автомобиль, как и прежде «НИВА»!. Автомобиль превратился в легенду, и лишить его имени невозможно.
Приводя цитату из Top Gear, где телеведущий и журналист Джеймс Мэй оценивает нашу машину: «„Нива“, запущенная в производство в 1977 году, была первой „Ладой“, не копирующей итальянские седаны. В то время как всё, что находилось под капотом, принадлежало Fiat, система управления и корпус были трудами великолепной работы „Лады“. Она получила свою репутацию
за живучесть, достигла кое-каких успехов во внедорожных гонках и заработала престиж у землевладельцев и у других людей без чувства иронии. И даже сейчас, несмотря на первоначальный скептицизм, она способна унизить более крупных и современных конкурентов на бездорожье». Нынешний интерес программы Top Gear к 40-летней модели «Нива» неслучаен.
В Великобритании перестал продаваться архаичный Land Rover Defender. И жителям сельских районов русская простая и надежная «Нива» видится достойной альтернативой их Defender-у. Потребность в простой и неприхотливой конструкции, ремонт которой доступен и в гараже, и в поле, до сих пор велика. Эпоха «Нивы» продолжается — поздравляем с ЮБИЛЕЕМ!
Поздравляем С Новым 2017 Годом!
Поздравляем всех с Новым 2017 годом! Мы желаем всем Новогоднего настроения, и пусть в наступающем Новом Году сбудутся все ваши мечты! С наилучшими пожеланиями команда сайта nivapechka.com
Расписание работы на Новогодние праздники. В магазинах на ул.Трикотажной и на авторынке «Столица» ул.Петухова 51Г праздничные дни с 01.января 2017 года по 04.января 2017 года включительно. 05-06 января рабочие дни, 07-08 января праздничные дни. С 09 января 2017 года работа по обычному расписанию. Отправка заказов в регионы в новом 2017 году возобновится с 14.01.2017 года.
31.08.2016 26.02.2016
Профилактика гибочного пресса с 02 марта по 15 марта 2016г.
В период с 02 марта по 15 марта у нас будут производиться работы по профилактике и перенастройке гибочного пресса. В связи с этим заказы, оформленные (и оплаченные) в период с 02.03.2016г по 15.03.2016г, будут отправлены в срок до 19 марта 2016 года. Далее оформление и отправка заказов будет производиться в обычном графике. Заказы, оформленные (и оплаченные) до 02 марта 2016г будут отправлены по обычному расписанию (без задержек). С наилучшими пожеланиями команда сайта nivapechka.com
21.12.2015 21.12.2015
Расписание работы на Новогодние праздники.
В магазинах на ул.Трикотажной и на авторынке «Столица» ул.Петухова 51Г праздничные дни с 01.января 2016 года по 11.января 2016 года включительно. С 12 января 2016 года работа по обычному
расписанию. Отправка заказов в регионы в этом году до 26.12.2015 года включительно. В новом 2016 году отправка возобновится с 15.01.2016 года. Это связанно с расписанием работы транспортных компаний в Новогодние праздники, а также из-за значительного предпраздничного ажиотажа на Почте России.
Поэтому отправка заказов в период с 26.12.2015г по 15.01.2016г производится не будет. Надеемся на ваше понимание.
Сайт Нива печка получил обновленный дизайн и доступен на мобильных устройствах.
Мы запустили обновленную версию сайта Нива-печка. Теперь пользоваться сайтом Нива-печка удобно и на мобильных устройствах. Как и прежде никакой посторонней рекламы. Только полезная информация касающаяся вентиляции и отопления автомобиля Нива LADA 4×4 URBAN. Как сделать Ниву комфортней и удобней в эксплуатации. Как самостоятельно установить Нива-печка с салонным фильтром в домашнем гараже. И другие вопросы как сделать Ниву лучше. Надеемся вам будет удобно пользоваться нашим сайтом nivapechka.com
LADA 4×4 URBAN Нива кондиционер и печка с салонным фильтром.
Мы адаптировали комплекты Нива-печка «МАКСИ КЛАССИК» и «МАКСИ С САЛОННЫМ ФИЛЬТРОМ» для установки в новые автомобили LADA 4×4 URBAN и Лада 4х4 Урбан! Наличие подробной инструкции по установке позволяет произвести установку Нива-печка даже самостоятельно в домашнем гараже. А бумажный салонный фильтр промышленного производства надежно защитит радиатор отопителя и кондиционера, а так же салон Нивы от пыли и тополиного пуха.
Изменение цен с 4 января 2015 года.
У нас произошло изменение цен на комплекты и комплектующие Нива-печка с 4 января 2015 года по известным причинам. Мы работаем с различными поставщиками: металла, моторов 2108, мелких комплектующих. Однако мы прилагаем все усилия, которые зависят от нас, чтобы эти изменения были минимальными.
Установка вентилятора от ваз 2108 на ниву
Переделка печки на Ниве 21213 своими руками необходима при сбое в работе системы отопления автомобиля. Медлить с этим не стоит, ведь неравномерная термическая регуляция приводит к запотевшим стеклам или обледенению. В любом из указанных случаев ухудшается обзор происходящего на дороге. Неисправность вызывает износ отдельных элементов устройства или заводской брак.
Диагностирование неисправности
Потребуется переделка печки, поставляемой в штатной комплектации, в профилактических целях. Много времени процедура не отнимет, зато предотвратит множество проблем в будущем. Водительский опыт говорит о том, что первые сильные морозы подкосят «здоровье» устройства. Список основных слабых мест выглядит следующим образом:
- оптимальный диапазон рабочей температуры модели 2121 от -5 до +10°С;
- неспособность прогреть воздух в салоне, если за бортом -8°С и ниже;
- при увеличении мощности обдува не происходит увеличение температуры;
- при езде на II передаче шум от печки Нивы становится существенным.
Именно поэтому лучше заблаговременно принять необходимые меры. Альтернатив у водителя немного. С одной стороны, все остается на своих местах. Отопительное устройство используется на минимальной мощности. Во время мягких зим подобное еще терпимо, но с приходом настоящих холодов условия станут невыносимы. С другой стороны, несложно потратить несколько часов для исправления ситуации.
Дальнейшее развитие событий идет следующим образом. Если отопление в машине работает на ½ мощности, можно ограничиться незначительным ремонтом. Главное — убедиться в отсутствии шумов и посторонних стуков, иначе Нива 21213 должна немедленно отправиться на технический осмотр.
Наличие неприятного звукового сопровождения говорит о необходимости замены устройства. В специализированной торговой сети представлены готовые варианты отопительных механизмов на Ниву. При желании таковой собирается самостоятельно.
Второй вариант считается более предпочтительным. При самостоятельной сборке есть возможность в буквальном смысле персонализировать печку. Для выполнения работы своими руками понадобится посетить специализированный магазин или рынок для покупки запчастей.
При покупке выбираются оригинальные детали или аналоги. Главное, чтобы они имели сертификат качества. В противном случае поставить их нельзя. Нелишним будет переписать технические данные транспортного средства, чтобы не превысить рекомендованные заводом-изготовителем параметры.
Технические тонкости процедуры
Эффективность работы новой отопительной системы на Ниве определит не стоимость купленных деталей, а их качество. Для работы понадобятся следующие элементы: автомобильный резистор, отопитель восьмерки и «улитка». Ошибочно полагать, что подойдут только «родные» запчасти для ремонта отопительного устройства. Главное требование — техническая совместимость.
Если возникают сомнения, ясность внесет чертеж системы отопления. Дальнейший порядок действий выглядит следующим образом:
-
Вырезать новое посадочное отверстие. Делается это аккуратно, ведь от качества подготовительного процесса зависит надежность эксплуатации системы обогрева. Рекомендуется поместить двигатель в воздуховод как можно ниже, иначе устройство будет упираться в капот. Допускать подобного не стоит, иначе вентилятор печки долго не продержится.
Проверяется отопительная система нового образца пробным включением. Рекомендуется плавно переключать режимы. На каждом из них устройство должно находится не менее 5-7 минут. Задача водителя — убедиться в том, что работа системы не сопровождается посторонними шумами и вибрацией.
Оригинальные детали vs аналоги: практические советы
Как уже было сказано ранее, подобный выбор не отражается на качестве работы отопительной системы. При этом автослесари делают несколько оговорок. Тем, кто планирует использовать печки ВАЗ, нелишним будет проверить систему питания. У некоторых модификаций она отличается. Именно поэтому все действия согласуются с чертежами.
Допускается использование отопителя ВАЗ 2108 при условии соблюдения двух рекомендаций. Во-первых, посадочное гнездо на 1-2 см больше размера устройства. Дополнительная площадь снизит вибрационное воздействие. Во-вторых, переключатель устанавливается с учетом специфики отопительной системы ВАЗ. Меньше придется повозиться, когда необходима незначительная доработка системы.
Вентиляционная система обновляется за 1-2 часа в зависимости от степени износа движка.
Если установленная заводом-изготовителем «улитка» не имеет следов физического износа, необходимо только заменить сам «движок» отопителя.
Хуже, если заводская комплектация модели Шевроле имеет производственные дефекты. Рекомендуется полная замена устройства. Это сэкономит время.
Работа системы отопления определяет комфортность и безопасность езды. Водитель постоянно отслеживает эффективность работы системы. В случае появления посторонних шумов необходимо срочно провести технический осмотр.
Печка в Ниве откровенно говоря плохая! Одной из ее самых важных проблем является собственно сам вентилятор, которые установлен под радиатором, да к тому же еще и вертикально. Проходя через него горячий воздух сильно нагревает его и вся смазка постепенно стекает с ротора. Как следствие моторчик начинает визжать! Наверное все знают эту проблему! Ну а производительность там вообще на нуле.
Ставим «улитку» от ВАЗ-2108 и получаем увеличение производительности, тищину, и при желании три скорости управления.
Идея не нова, я позаимствовал ее на других сайтах. Только каждый делает по своему — вот как сделал я.
При всем этом, после переделки мотора печки вообще не слышно так как сам мотор теперь стоит в подкапотном пространстве!
Разбираем полностью весь отопитель!
При желании иметь три скорости — в нижнюю чать корпуса, со стороны водителя, врезаем резистор печки от ВАЗ-2108/М2141
Все стыки корпуса, а особенно место установки радиатора ваз 2121, проклеиваем резиновым уплотнителем (есть в любом строительном магазине)
Собираем нижнюю часть, двигатель ваз 2131 с вентилятором от туда просто выкидываем! Он нам больше не нужен!
Разбираем верхнюю часть отопителя, вынимаем решетку из воздухозаборника нива 2121.
И аккуратно с минимальными зазорами вырезаем место под «улитку» от ВАЗ-2108. Устанавливаем ее так, как позакано на фото (вид снизу)
Оставшуюся полость запоняем монтажной пеной! Затем, после застывания, срезаем ее вровень с нижней частью корпуса воздухозаборника.
Вот такой вот воздухозаборник нива 2131 должен получиться!
Одеваем уплотнитель и устанавливаем под капот!
Информационно — познавательный портал для автомобилистов
Печка в Ниве откровенно говоря плохая! Одной из ее самых важных проблем является сам вентилятор, который зачастую издает визжащие звуки да и производительность его довольно низка…
Основной причиной неприятных звуков вентилятора является тот факт, что он установлен под радиатором, да еще и в вертикальном положении. Проходя через него, уже нагретый воздух, сильно нагревает двигатель самого вентилятора и вся смазка постепенно стекает с ротора. Как следствие моторчик начинает визжать, так как втулки со временем остаются почти без смазки. Думаю многие знакомы с этой проблемой!
Но проблема решаема!
Ставим «улитку» от ВАЗ-2108 и получаем увеличение производительности, тишину, и при желании три скорости управления.
Сама идея в общем то не нова, я позаимствовал ее так же на одном из форумов. Только каждый делает по своему. Вот как сделал я…
Одно из основных преимуществ после переделки, мотора печки вообще не слышно, так как сам мотор теперь стоит в подкапотном пространстве!
Итак, процесс:
Снимаем с машины и разбираем отопитель…
При желании иметь три скорости, в нижнюю часть корпуса, со стороны водителя, врезаем резистор печки от ВАЗ-2108/М2141
Все стыки корпуса, а особенно место установки радиатора, проклеиваем резиновым уплотнителем (его можно купить в любом строительном магазине)
Собираем нижнюю часть. Сам вентилятор туда не ставим, просто выкидываем, он нам больше не нужен!
Разбираем верхнюю часть отопителя, вынимаем решетку из воздухозаборника…
И аккуратно с минимальными зазорами вырезаем место под «улитку» от ВАЗ-2108. Устанавливаем ее так, как показано на фото ниже (вид изнутри)
Оставшуюся полость, так же аккуратно, заполняем монтажной пеной, заклеив все «ненужные» места малярным скотчем, что бы избежать склеивания самого вентилятора!
Затем, после застывания, срезаем ее вровень с нижней частью корпуса воздухозаборника.
Вот такой воздухозаборник должен получиться в итоге:
Одеваем на него уплотнитель и устанавливаем под капот на своё место…
Как видите усилий требуется не так много и результат того стоит! Производительность значительно увеличивается и салон быстрее прогревается.
Схема подключения 08 вентилятора печки на ниву
Переделка печки на Ниве 21213 своими руками необходима при сбое в работе системы отопления автомобиля. Медлить с этим не стоит, ведь неравномерная термическая регуляция приводит к запотевшим стеклам или обледенению. В любом из указанных случаев ухудшается обзор происходящего на дороге. Неисправность вызывает износ отдельных элементов устройства или заводской брак.
Диагностирование неисправности
Потребуется переделка печки, поставляемой в штатной комплектации, в профилактических целях. Много времени процедура не отнимет, зато предотвратит множество проблем в будущем. Водительский опыт говорит о том, что первые сильные морозы подкосят «здоровье» устройства. Список основных слабых мест выглядит следующим образом:
- оптимальный диапазон рабочей температуры модели 2121 от -5 до +10°С;
- неспособность прогреть воздух в салоне, если за бортом -8°С и ниже;
- при увеличении мощности обдува не происходит увеличение температуры;
- при езде на II передаче шум от печки Нивы становится существенным.
Именно поэтому лучше заблаговременно принять необходимые меры. Альтернатив у водителя немного. С одной стороны, все остается на своих местах. Отопительное устройство используется на минимальной мощности. Во время мягких зим подобное еще терпимо, но с приходом настоящих холодов условия станут невыносимы. С другой стороны, несложно потратить несколько часов для исправления ситуации.
Дальнейшее развитие событий идет следующим образом. Если отопление в машине работает на ½ мощности, можно ограничиться незначительным ремонтом. Главное — убедиться в отсутствии шумов и посторонних стуков, иначе Нива 21213 должна немедленно отправиться на технический осмотр.
Наличие неприятного звукового сопровождения говорит о необходимости замены устройства. В специализированной торговой сети представлены готовые варианты отопительных механизмов на Ниву. При желании таковой собирается самостоятельно.
Второй вариант считается более предпочтительным. При самостоятельной сборке есть возможность в буквальном смысле персонализировать печку. Для выполнения работы своими руками понадобится посетить специализированный магазин или рынок для покупки запчастей.
При покупке выбираются оригинальные детали или аналоги. Главное, чтобы они имели сертификат качества. В противном случае поставить их нельзя. Нелишним будет переписать технические данные транспортного средства, чтобы не превысить рекомендованные заводом-изготовителем параметры.
Технические тонкости процедуры
Эффективность работы новой отопительной системы на Ниве определит не стоимость купленных деталей, а их качество. Для работы понадобятся следующие элементы: автомобильный резистор, отопитель восьмерки и «улитка». Ошибочно полагать, что подойдут только «родные» запчасти для ремонта отопительного устройства. Главное требование — техническая совместимость.
Как отремонтировать печку ВАЗ 2107? Из этой статьи вы все узнаете, а так же сможете произвести ее ремонт своими руками. Проблема ремонта печки ВАЗ 2107, как правило, возникает перед похолоданиями. Кто обращается в автосервисы, кто пытается сделать такой ремонт самостоятельно, но в любом случае никто не хочет ездить зимой на автомобиле с не работающей печкой.
Отечественный автопром, как бы о нем не отзывались, все же по-своему печется о пользователях автомобилей, которые они выпускают. Поскольку зимы в нашей климатической зоне суровые, то автомобили отечественного производства шли с конвейера с мощными системами отопления салона. Касается это и автомобилей Волжского автомобильного завода (ВАЗ). Все выпускаемые заводом модели, как «классика» ВАЗ-2101 – ВАЗ -2107, так и последующие, ВАЗ-2108 – ВАЗ-21099, ВАЗ-2110 и т.д. обладают хорошей системой отопления.
Если брать во внимание модели ВАЗа от 2101 до 2107, то система отопления у них идет одинаковая и состоит из одних и тех же составных частей, подводящего и отводящего патрубков, радиатора, кранов и электромотора с вентилятором. И хоть эта система довольно проста, но в процессе эксплуатации она может выйти из строя. Разберем на примере, как произвести ремонт печки ВАЗ 2107.
От слов к делу
У подводящего и отводящего патрубков, по сути, никакой нагруженной работы нет, они всего лишь перепускают жидкость из системы охлаждения в радиатор отопления салона и отводят обратно. Но бывают случаи, когда эти патрубки начинают давать течь. Протекать они могут в местах соединения, или же в случае трещины на самом патрубке.
Если подтеки появились в местах соединения, то нужно просто поменять в местах соединения резиновые прокладки. Если же на каком-либо патрубке появилась трещина, то есть несколько вариантов решения проблемы. Поскольку патрубки делаются из латуни, то трещину можно запаять или же на место, где протекает жидкость, можно наложить резиновую шину и закрепить ее хомутами. Если выходит из строя кран, то ремонту он не подлежит, его просто заменяют.
Не так все просто
Самым сложным случаем является засоренность трубок радиатора печки. В таком случае ремонт печки ВАЗ 2107 довольно затруднен, потому что радиатор сделан из латуни и в местах стыковок, составляющих радиатора, применялась пайка. Поэтому чтобы почистить радиатор, его нужно распаивать.
После того, как он распаян, трубки радиатора нужно тщательно прочистить. Сделав прочистку радиатор нужно снова запаять. Это является сложной операцией, поскольку в местах с не качественной пайкой радиатор будет протекать.
Важный момент — электромотор
Также в процессе эксплуатации печки ВАЗ-2107 возможен выход из строя электромотора. Спешить менять его не стоит, поскольку причиной неработающего эл. двигателя может быть окисление графитных щеток, из-за чего они не контактируют с ротором двигателя. В таком случае стоит просто разобрать электродвигатель и хорошо почистить посадочные места щеток. Если же двигатель начал «пищать», то скорее всего в нем вытекла смазка между статором и ротором.
Нужно разобрать двигатель и нанести новую смазку на посадочные места ротора. Также существует вероятность износа посадочных мест, поскольку двигатель не больших размеров и на нем не устанавливаются подшипники.
Ремонт такой поломки не возможен и электродвигатель просто заменяется.Поскольку двигатель, устанавливаемый на ВАЗ-2107 является маломощным, то часто владельцы этого автомобиля меняют его на более мощный, который устанавливается на ВАЗ-2108.
Но поскольку этот электродвигатель не подходит по посадочным местам в кожухе, то потребуется небольшая переделка кожуха.
Вопросу обогрева салона любого автомобиля следует уделять достаточное внимание, поскольку это благоприятствует не только повышению уровня комфорта, но и обеспечению безопасности во время осуществления движения. не способна устранить ледяное покрытие, возникшее на лобовом и боковых стёклах. Безусловно, стёкла, покрытые льдом, сводят видимость к нулевой отметке. Водителю только нужно применить механическое воздействие, чтобы ликвидировать хотя бы частично лёд, в противном случае имеется возможность ехать только вслепую, что чревато аварийными ситуациями.
К сожалению, печка на вашей Ниве хоть и имеет некоторые преимущества, но вместе с ними сопровождается некоторыми явными недостатками. В частности, одним из таких существенных недостатков является недостаточно мощный вентилятор, который не способен обеспечивать нормальную подачу тёплого воздуха, но при этом ещё его работа сопровождается чрезмерным посвистыванием и шумом. Конечно, кое-кто примет решение посетить автомагазин, выбрать новый вентилятор и установить его, распрощавшись со старым, приносящим вам, как водителю, проблемы. Однако большинство автовладельцев не считают такой вариант решения проблемы правильным. Установка нового элемента решит проблему только на некоторое время, а через определённый промежуток времени вновь вам придётся столкнуться с тем, что он начинает издавать раздражающие звуки и плохо гнать воздух.
Мы рекомендуем вам задуматься об установке на вашу Ниву. Как показывает практика, установка такой печки позволяет надолго забыть о проблеме плохого обогрева салона. Можно также модернизировать имеющуюся печку, воспользовавшись некоторыми комплектующими, взятыми с ВАЗ-2108.
Модернизация печки
Чтобы модернизировать печку на вашей Ниве, предлагаем вам позаимствовать, прежде всего, вентилятор печки ВАЗ-2108. Мы не рекомендуем его устанавливать вместо того, что уже установлен на вашей Ниве, кстати, это у вас вряд ли и получится, поскольку он располагается в салоне авто. Внедрить вентилятор от 2108 в салон будет проблематично, поэтому ему находят более подходящее пространство в моторном отсеке. Модернизация печки предполагает установку дополнительного вентилятора, чем мы и предлагаем заняться вам.
Алгоритм замены вентилятора
Первоначально предлагаем вам снять коробку воздухозаборника, который в водительской среде имеет и другое народное название «сапог». Снимать его самостоятельно не очень удобно, поэтому рекомендуем вам привлечь к выполнению этой процедуры своего друга. Неудобство заключается в том, что гайки нужно откручивать, находясь в салоне, а сами болты удерживать со стороны подкапотного пространства. Свободная ваша рука уж точно не достанет до подкапотного пространства. После того как все гайки будут откручены, снимите воздухозаборник.
Теперь вам предстоит выполнить некоторые манипуляции, чтобы переделать извлечённый воздухозаборник, а затем внедрить в него . В противном случае вам не удастся закрыть капот, поскольку вентилятор будет мешать замку.
Итак, вам нужно срезать на воздухозаборнике пластик сбоку, а на самом вентиляторе — выступающие в стороны детали крепления. После того как вентилятор отлично разместился во внутреннем пространстве воздухозаборника, закрепите его герметиком. Вокруг сопла вентилятора умостите подходящий материал. Это позволит вам исключить потерю оттока воздуха. Теперь водрузите ваш модернизированный кожух с вентилятором, попробуйте закрыть капот.
Алгоритм замены моторчика
Нелишним будет рассмотреть вопрос установки моторчика печки, заимствованной у «восьмёрки». В этом случае тоже удастся значительно улучшить работу печки. Снятый восьмёрочный моторчик также требуется первоначально примерить в воздухосборнике, при необходимости вырезать болгаркой дополнительное пространство, чтобы он успешно в нём мог разместиться. После того как вы убедитесь в его нормальной «посадке», рекомендуем моторчик зафиксировать герметиком, чтобы исключить возможную вибрацию в процессе передвижения на авто. Безусловно, родной движок следует выбросить, а все провода подключить к только что вами установленному механизму.
Моторчик печки от «восьмёрки»
Тюнинг салона нива 2121 своими руками, советы доработке салона, внутренний тюнинг нива 2131, ваз 2121. Установка новой улитки отопителя Доработка салона, тюнинг салона Нива 2121, Нива 2131, Нива 4×4Установка новой улитки отопителя фото, тюнинг салона Ваз 2121, Ваз 2131 своими руками
Тюнинг автомобилей ваз — это повышение заводских характеристик автомобиля. Доработка нива 2121 — это прежде всего установка новых бамперов, защиты картера, лебедки. По желанию владельцы этих внедорожников устанавливают дополнительные противотуманные фары. В наших разделах описаны инструкции и советы по доработке нива 2131 различных агрегатов, таких как раздатка и т.д. Комплексный тюнинг ваз своими руками сможет сделать даже автолюбитель. Также вы найдете категории по тюнингу двигателя, тюнингу коробки передач, тюнингу салона и кузова, также множество фото отчетов тюнинга ваз 2121. Благодаря интересным решениям тюнинг нива доставит вам массу удовольствия и выгоды. Если у вас есть фотографии тюнинга ваз — присылайте нам на почту.Печка в Ниве откровенно говоря плохая! Одной из ее самых важных проблем является собственно сам вентилятор, которые установлен под радиатором, да к тому же еще и вертикально. Проходя через него горячий воздух сильно нагревает его и вся смазка постепенно стекает с ротора. Как следствие моторчик начинает визжать! Наверное все знают эту проблему! Ну а производительность там вообще на нуле…
Проблема решаема!
Ставим «улитку» от ВАЗ-2108 и получаем увеличение производительности, тищину, и при желании три скорости управления.
Идея не нова, я позаимствовал ее на других сайтах. Только каждый делает по своему — вот как сделал я…
При всем этом, после переделки мотора печки вообще не слышно так как сам мотор теперь стоит в подкапотном пространстве!
Разбираем полностью весь отопитель!
При желании иметь три скорости — в нижнюю чать корпуса, со стороны водителя, врезаем резистор печки от ВАЗ-2108/М2141
Все стыки корпуса, а особенно место установки радиатора ваз 2121, проклеиваем резиновым уплотнителем (есть в любом строительном магазине)
Собираем нижнюю часть, двигатель ваз 2131 с вентилятором от туда просто выкидываем! Он нам больше не нужен!
Разбираем верхнюю часть отопителя, вынимаем решетку из воздухозаборника нива 2121…
И аккуратно с минимальными зазорами вырезаем место под «улитку» от ВАЗ-2108. Устанавливаем ее так, как позакано на фото (вид снизу)
Оставшуюся полость запоняем монтажной пеной! Затем, после застывания, срезаем ее вровень с нижней частью корпуса воздухозаборника.
Вот такой вот воздухозаборник нива 2131 должен получиться!
Одеваем уплотнитель и устанавливаем под капот!
Дополнительная панель приборов Установка дополнительной панели приборов Нива 2121, Ваз 2131 |
Установка новой бороды Новая борода от 21213 на Нива 2121, Ваз 2131 |
Доработка отопителя салона Установка дополнительного вентилятора для улучшения обогрева салона Нива 2121, Ваз 2131 |
Панель приборов от Газ 3110 вместо стандартной панели Панель приборов ГАЗ 3110 вместо панели Нива 2121, Ваз 2131 |
Подсветка замка зажигания от ВАЗ-2110 Установка подсветки замка зажигания от 2110 на Нива 2121, Ваз 2131 |
Доработка обдува печки Доработка печки Нива 2121, Ваз 2131 |
Доработка подсветки приборов Доработка подсветки приборов старой панели Нива 2121, Ваз 2131 |
petra: улитка 2108 в ниву
Одеваем уплотнитель и устанавливаем под капот!
Вот такой вот воздухозаборник нива 2131 должен получиться!
Оставшуюся полость запоняем монтажной пеной! Затем, после застывания, срезаем ее вровень с нижней частью корпуса воздухозаборника.
И аккуратно с минимальными зазорами вырезаем место под «улитку» от ВАЗ-2108. Устанавливаем ее так, как позакано на фото (вид снизу)
Разбираем верхнюю часть отопителя, вынимаем решетку из воздухозаборника нива 2121…
Собираем нижнюю часть, двигатель ваз 2131 с вентилятором от туда просто выкидываем! Он нам больше не нужен!
Все стыки корпуса, а особенно место установки радиатора ваз 2121, проклеиваем резиновым уплотнителем (есть в любом строительном магазине)
При желании иметь три скорости — в нижнюю чать корпуса, со стороны водителя, врезаем резистор печки от ВАЗ-2108/М2141
Разбираем полностью весь отопитель!
Печка в Ниве откровенно говоря плохая! Одной из ее самых важных проблем является собственно сам вентилятор, которые установлен под радиатором, да к тому же еще и вертикально. Проходя через него горячий воздух сильно нагревает его и вся смазка постепенно стекает с ротора. Как следствие моторчик начинает визжать! Наверное все знают эту проблему! Ну а производительность там вообще на нуле… Проблема решаема! Ставим «улитку» от ВАЗ-2108 и получаем увеличение производительности, тищину, и при желании три скорости управления. Идея не нова, я позаимствовал ее на других сайтах. Только каждый делает по своему — вот как сделал я… При всем этом, после переделки мотора печки вообще не слышно так как сам мотор теперь стоит в подкапотном пространстве!
Улитка отопителя от 2108 на Нива 2121, Ваз 2131, Лада 4х4
Тюнинг салона нива 2121 своими руками, советы доработке салона, внутренний тюнинг нива 2131, ваз 2121.
НИВА / 2121, 2131 / тюнинг / салона / Установка новой улитки отопителя
Улитка отопителя от 2108 на Нива 2121, Ваз 2131
Доработка печки Нива (Шевроле, 21213-4 и др.) » МОДЕРНИЗАЦИЯ+УЛУЧШЕНИЕ отопителя
Содержание:
- Из чего состоит «система отопления»
- Возможные недостатки или поломки отопителя LADA 4×4
- Как улучшить работу отопителя, какую печку поставить на Ниву
Всем привет! Россия – страна не только большая, но ещё и холодная. У нас, как и в большинстве стран постсоветского пространства зимой холодно. Сейчас уже осень, а потому сегодня пойдёт разговор о различных вариантах как допилить-докрутить-доделать «родную» печку Нива 21213.
Из чего состоит «система отопления»
Модернизация печки «Нива» начинается с изучения конструкции, с которой предстоит иметь дело. Если не брать во внимание самые современные и весьма дорогие модели Lada с иностранной начинкой, то обогрев салона вкупе с его вентиляцией устроен почти во всех машинах ВАЗ плюс-минус одинаково. Попробуем разобрать всё это «на пальцах».
Нива
При движении машины через «жабры» в капоте поток уличного воздуха попадает в довольно простую систему пластиковых трубок различного сечения и диаметра. Нагрев воздуха обеспечивает радиатор, к которому подведены каналы на печку – трубки ввода-вывода охлаждающей жидкости, посредством которой происходит, собственно, охлаждение силового агрегата.
Циркуляцию нагретого воздуха обеспечивает вентилятор с электромотором. Добавить или убавить температуру позволяет кран печки. Он, как и заслонки отдельных дефлекторов имеет тросовый привод. Управление всем этим нехитрым хозяйством выведено на центральную панель «Нивы». Водитель переводит рычаг в нужное положение и трос, соответственно, открывает-закрывает кран печки. Второй рычаг позволяет оперировать трёхрежимным вентилятором, способным дуть сильнее, слабее и в среднем диапазоне. Наконец, третий рычажок меняет расположение заслонок дефлекторов, переводя поток в ноги, на лобовое стекло или в салон.
Не сказать, что всё это архисложно или заумно.
Шеви Нива
У чуть более современного образца автомобиля Нива… всё то же самое. За исключением чуть более современного внешнего вида органов управления печкой. В остальном это всё та же конструкция из пластика с системой воздуховодов, салонным фильтром и версией с кондиционером. Последний, правда, установлен под капотом, а никак не интегрирован в структуру подторпедного пространства. Разве что в пространство между радиатором и вентилятором выведен испаритель, который, при включенном кондиционере охлаждает циркулирующий поток воздуха.
Справедливости ради уточним, что на свежих моделях классического внедорожника, на той же Нива Урбан, оснащаемой кондиционером, тоже может присутствовать аналогичное решение.
Назад к содержанию
Возможные недостатки или поломки отопителя Lada 4×4
Перечислив частично элементы конструкции ВАЗовской печки, мы, пожалуй, заодно «набросали» круг проблем по данному узлу в автомобиле Нива 21214, с которыми может столкнуться любой владелец данной машины.
- Стойкий «аромат» тосола в салоне авто свидетельствует, что потёк кран отопителя.
- Не удаётся перенаправить тёплый воздух с лобового стекла на обогрев салона? Легко мог оборваться тросик, связывающий рычаг с заслонками.
- Пропал характерный шум вентилятора и перестал дуть воздух в салон? Поздравляем – пришло время разбирать панель и менять электровентилятор печки.
- Неравномерно распределяется поток воздуха (это больше доработка отопителя Шевроле Нива)?! Придётся установить новые пластиковые направляющие пластины, чтобы заслонки более чётко занимали своё положение. Ещё вариант – доработка воздуховодов, но тут уже каждый пробует свои инженерные решения.
И… простите, но это далеко не полный перечень вероятных неполадок. Так уж распорядился создатель любимого почти всеми покорителями бездорожья автомобиля, что всегда найдётся, что доделать-дошлифовать в Ниве. Начиная с того, что сам вентилятор дует часто еле-еле и при этом шумит, как ракетный двигатель, заканчивая тем, что воздух, как уже было указано ранее, поступает в салон машины исключительно с улицы, а потому при закрытом лючке циркуляция воздуха внутри авто прекращается. Чтобы справиться с этим недостатком многие умельцы… выпиливают в корпусе печки отверстие.
Также, могут быть повреждены/изношены/изначально не совпадать патрубки отопителя. Наконец, элементарный резистор, отвечающий за режимы работы вентилятора, очень даже нередко выходит из строя.
Назад к содержанию
Как улучшить работу отопителя, какую печку поставить на Ниву
На просторах Сети полным-полно ценных (и не очень) советов по приведению в порядок отечественного внедорожника с уже более чем 40-летней историей! И доработка печки «Нива» в этом наборе занимает отдельное место.
Перебрать всё подряд
Первый и наиболее очевидный вариант улучшения качества работы любого механизма – обслужить его. Бывалые механики советуют начинать ремонт печки Нивы того, что меняем шланги подачи, а заодно и хомуты. Со временем каждая резинка или фитинг могут зачерстветь, задубеть и перестать работать, как следует.
Мотор печки, какой лучше
Для опытного Нивавода не секрет, что производительность «родного» мотора отопителя оставляет желать много лучшего. Поэтому его часто меняют на схожий элемент из ВАЗ-2108. Так дует лучше, хотя с процессом установки придётся повозиться – в Сети можно найти пошаговый разбор этого улучшения.
Впрочем, существует готовая печка на Ниву, которую легко установить и подключить взамен штатного устройства. Она укомплектована надёжным и долговечным вентилятором «LUZAR»:
Ставим второй вентилятор
Есть и более радикальный метод. Задумываясь – какой лучше радиатор печки установить или как частично довести её до ума, многие владельцы Нивы всё же приходят к выводу, мало установить новую печку – нужно обеспечить постоянный приток воздуха. Для этого в корпусе воздухозаборника устанавливается дополнительный вентилятор от ВАЗ-2108 по принципу «улитка».
Ну, мотор тоже можно обновить – есть чуть модернизированный вариант от «Калины»:
Защитная сетка – дёшево и просто
Наблюдательные водители легко заметят, что в кожухе воздухозаборника и даже в решётке радиатора отопителя скапливается много мусора и грязи. Всё это физически препятствует притоку воздуха, а потому элементарная прочистка и промывка позволяют облегчить поступление воздуха в машину. А чтобы не повторять процедуру ежемесячно – достаточно кустарным способом соорудить элементарную сетку из капрона и проволочного каркаса и установить её на входном отверстии воздухозаборника. И не нужно ломать голову над извечными вопросами: Кран отопителя, какой лучше? Менять ли радиатор? Нужна ли замена мотора печки, если он дует нормально и не шумит?
Тюнинг для пассажиров: отопитель второго ряда
Дополнительный отопитель салона на семейства «Нива» устанавливается под переднее пассажирское кресло, а предназначен для подачи тепла в ноги пассажиров заднего ряда. Имеет две скорости работы и позволяет эффективно, и быстро обогревать салон внедорожника.
Назад к содержанию
Будем на связи
В общем, на этом вопросы про улучшение печки Нива и тему «доработка печки Нива Шевроле» считаем завершённым. Напоминаем, что компания SV-PARTS присутствует во многих социальных сетях. Также различные полезные статьи публикуются в нашем блоге.
Присоединяйтесь к нам в VK и в Instagram. А также подписывайтесь на наш YouTube-канал, где часто размечаются рекомендации по подбору запчастей на автомобиль Нива.
Вернуться к списку статейФлуоресцентный пигмент позволяет различать виды улиток-двойников
ВВЕДЕНИЕ
Окраска мягкого тела обычно не используется в качестве ключевого признака в таксономии раковинных моллюсков, в основном потому, что для изучения цвета и окраски необходимы живые или свежие экземпляры вариации сохраняются не так легко, как структурные вариации раковины или мягкого тела (Stum et al., 2006). У слизней окраска мантии может различаться генетически (Williamson, 1959) или в зависимости от пищи внутри вида, что вносит путаницу в таксономию близкородственных видов (Reise, 1997; Jordaens et al., 2001). Что касается окраски мантии легочных улиток, то практически не было изучено почти ни одного случая приобретенного изменения и лишь несколько примеров генетической изменчивости (Саin, 1959; Murray, 1963; Cain et al., 1968; Wolda, 1969; Richards, 1973). , 1978), возможно, потому, что в целом раковины привлекают гораздо больше внимания.
Различия в окраске мантии между Bradybaena pellucida Kuroda и Habe (Habe, 1953) и B. Similaris (Rang, 1831) открывают возможности для биологических исследований окраски мантии из-за их подходящих характеристик для полевых и лабораторных исследований (Asami et al., 1997б; Асами и Асами, 2008 г.). Bradybaena Similaris (Férussac, 1821), которая часто упоминается для этого вида, является nomen nudum (Cowie, 1997). Первоначально Bradybaena pellucida была описана как немного отличающаяся от B. Similaris более высокой раковиной с более широкими оборотами, более тонким остракумом и блестящим бледно-желтоватым периостракумом, через который гепатопанкреас выглядит ярко-желтым вблизи вершины, при этом не обнаруживая явных различий в цвете. гениталии (Набе, 1953). Однако отчетливый желтый цвет B.pellucida имеет цвет не гепатопанкреаса, а спинной мантии (Asami et al., 1997b; Seki et al., 2002). В отличие от этого, B. Similaris демонстрирует окраску внутренних органов через почти прозрачную мантию с некоторыми белыми участками на вершине (рис. 1А). Цвет наружного покрова мягкого тела, выходящего за пределы раковины, от беловатого до бледно-светло-коричневого у B. pellucida, но более темно-коричневый у B. Similaris. Цвет периостракума часто бледно-беловато-желтый у B. pellucida, но коричневатый у B.аналогичный (рис. 1Б). Однако различия в раковинах непостоянны из-за различий внутри каждого вида. Оба вида также имеют схожие генетические системы, контролирующие окраску раковины и полиморфизм полос (Asami et al., 1993, 1997a; Asami and Asami, 2008). Таким образом, B. pellucida и B. Similaris надежно различаются только по окраске мантии. Однако, когда B. pellucida кормят искусственно приготовленным кормом (Asami and Ohbayashi, 1999), он теряет желтую окраску мантии, и его становится трудно отделить от B.Similaris (Asami et al., 1997a, b). Таким образом, было сомнительно, отличаются ли эти два вида генетически или морфологически друг от друга.
Рис. 1
Внешняя морфология Bradybaena pellucida (слева на каждой панели) и B. Similaris (справа на каждой панели). (A) Живые взрослые особи светло-коричневых полосатых морфов. (B) Пустые раковины взрослых светло-коричневых бесполостных морф; масштабная линейка, 5 мм.
Bradybaena pellucida является эндемиком Японии и распространена в основном в западном регионе, а также на юге полуострова Босо и некоторых других местах в центральной части Хонсю, тогда как B.Similaris является космополитом и населяет большинство островов Японии (Komai, Emura, 1955; Asami et al., 1997b; Seki et al., 2002). Смешанные колонии B. Similaris и B. pellucida обнаруживаются там, где их ареалы перекрываются, хотя их пятнистое распространение может быть отрицательно связано друг с другом (Asami et al., 1997b; Seki et al., 2002).
Мы изучили различия между B. pellucida и B. Similaris в пигментации мантии, морфологии полового члена и аллозимах. В этой статье показано, что флуоресцентный вторичный метаболит, который B.pellucida из естественной среды, подтверждает генетическое различие двух видов.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Для изучения окраски мантии и морфологии гениталий мы собрали живых взрослых особей и молодых особей (диаметром от 6 до 7 мм) B. pellucida в Широяме, Татеяме, и B. Similaris в Мияме, Фунабаси, Япония ( Рис. 2). Для исследования аллозимной изменчивости мы собрали образцы из трех одновидовых популяций каждого вида, в том числе из двух вышеуказанных участков на полуострове Босо (рис.2).
Рис. 2
Места сбора Bradybaena pellucida и B. Similaris в префектуре Тиба, Япония.
В течение двух дней после сбора мы удалили раковины 20 взрослых и 20 молодых особей каждого вида и исследовали спинную мантию под препаровальным микроскопом. Кроме того, мы кормили 20 взрослых особей и 20 молодых особей каждого вида кормом, состоящим из порошкообразной овсяной муки, яичной скорлупы и сухого корма для кошек, в контролируемых лабораторных условиях (16 часов света/8 часов темноты, 25°C) в течение 30 дней в соответствии с рекомендациями. протокол Асами и Обаяши (1999).Затем таким же образом, как описано выше, мы исследовали спинную мантию.
Из-за заметной яркости желтой пигментации B. pellucida мы проверили, излучает ли желтое вещество флуоресценцию в ультрафиолетовом излучении А, используя УФ-люминесцентную лампу (Blacklight, NEC, FL20S-BLB; пиковая длина волны: 360 нм). во тьме. Для каждого вида мы исследовали (1) спинную мантию 20 взрослых особей и 20 молодых особей в течение двух дней после сбора, (2) спинную мантию 20 взрослых особей и 20 молодых особей, которых кормили в лаборатории в течение 30 дней, и (3) пустые оболочки 20 взрослых.
Мы вырастили 20 мальков B. pellucida и B. Similaris, собранных в Сирояме и Мияме, соответственно, до зрелости в индивидуальных пластиковых контейнерах (62×50×25 мм) и позволили им размножаться в 10 межвидовых парах, согласно протокол Asami and Ohbayashi (1999), за исключением использования песка в качестве субстрата для откладки яиц. Мы вырастили до половой зрелости по пять потомков каждой из четырех межвидовых пар. Изучив цвет мантии и морфологию гениталий, мы подтвердили, что потомство было межвидовым гибридом, а не потомством, полученным путем самоопыления, на основе их гетерозиготного аллозимного профиля в локусе Pgm (таблица 1).В качестве контроля мы вырастили до половозрелости по пять потомков каждой из четырех внутривидовых пар каждого вида в тех же лабораторных условиях, что и гибриды.
Таблица 1
Анализируемые ферменты и локусы, а также буферные системы, используемые при электрофорезе в крахмальном геле.
Мы препарировали половую систему 20 взрослых особей каждого из двух видов, собранных в дикой природе, и по 20 взрослых особей каждого вида и гибридов F 1 , полученных в результате лабораторных скрещиваний. Мы фиксировали гениталии в 70% этаноле.Под препаровальным микроскопом мы исследовали возможные различия общей морфологии гениталий и скульптуры внутренней стенки полового члена, вскрытой в постоянной ориентации с помощью лезвия бритвы.
Кусочек гепатопанкреаса каждого живого образца гомогенизировали в равном объеме холодного 0,01 М трис-HCl-буфера (рН 6,8) и центрифугировали при 10000× g в течение 10 мин при 4°С. Супернатант подвергали электрофорезу на горизонтальном крахмальном геле с использованием четырех буферных систем для 11 ферментов (табл. 1).Аллозимы наблюдали с помощью методов окрашивания Murphy et al. (1996). Основываясь на электрофоретических паттернах, мы оценили частоты аллелей в 12 предполагаемых локусах.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Пигментные пятна
Как у B. pellucida, так и у B. Similaris у всех взрослых и молодых особей, собранных в дикой природе, было много пятен диаметром 0,01–0,02 мм каждое в спинной мантии под раковиной (рис. 3). ). Пятна B. pellucida были ярко-желтыми, тогда как пятна B. Similaris были белыми; оба типа были видны сквозь полупрозрачные оболочки.Пигментные пятна были только в спинной мантии, а не в других частях мантии или в других органах. У большинства взрослых особей B. pellucida, собранных в дикой природе, желтые пятна сливались, покрывая дорсальную поверхность шипа, который казался толстым и однородно желтым. Таким образом, цвет гепатопанкреаса не был виден сквозь скорлупу у живых взрослых особей B. pellucida. Желтые пятна были редкими на внешних оборотах. Окраска гепатопанкреаса имаго B. pellucida была видна вдоль узкой зоны между оборотами только при удалении раковины (рис.3А). В противоположность этому, белые пятна B. Similaris были плотными только на вершине и редко располагались в дорсальной части мантии шпиля. Так, у B. Similaris в основном наблюдалась темно-коричневая окраска гепатопанкреаса через мантию и раковину (рис. 3Б).
Рис. 3
Зависящие от окружающей среды изменения окраски мантии и гепатопанкреаса у взрослых особей Bradybaena pellucida (левые панели) и B. Similaris (правые панели). (A, B) Вид шпиля сверху без скорлупы до лабораторного кормления. (В, Г) Пятна, внедренные в мантию перед лабораторным кормлением; масштабная линейка, 0,05 мм. (E, F) Вид сверху на шпиль без скорлупы на 30-й день лабораторного кормления.
Плотность и распределение пятен на мантии различались у диких особей. Желтые пятна молодых B. pellucida из дикой природы были менее плотными, чем у взрослых особей; таким образом, их цвет гепатопанкреаса был виден сквозь скорлупу. В среде обитания B. pellucida типичная желтая окраска не обнаруживалась у большинства мальков размером менее 4 мм.Однако у собранных взрослых и молодых особей желтые пятна были слишком плотными вокруг вершины, чтобы можно было проверить, присутствуют ли также белые пятна.
В лабораторных условиях все дикие взрослые и ювенильные экземпляры B. pellucida начали терять желтую окраску с первого дня эксперимента, в то время как белые пятна B. Similaris не показали заметных изменений. В контейнерах, в которых взрослые или молодые особи B. pellucida содержались по отдельности, следы слизи на влажном бумажном полотенце, выстилавшем дно, часто были полупрозрачно-желтыми, особенно в начале лабораторного кормления, что позволяет предположить, что желтый пигмент просачивается из тела, предположительно со слизью.Мы подтвердили, что это также происходит в дикой природе, когда люди ползают по белой папиросной бумаге.
Хотя скорость исчезновения желтого цвета у разных особей различалась, все взрослые особи и молодые особи B. pellucida полностью утратили желтый пигмент в течение 30 дней. Однако мы не обнаружили никаких заметных признаков изменений в питании или других поведенческих действиях. Сняв раковины на 30-й день кормления, мы обнаружили только белые пятна на спинной мантии как у B. pellucida, так и у B. Similaris (рис.3). Эти пятна были такими же редкими, как и пятна на мантии B. Similaris до эксперимента с кормлением. Цвет самой гепатопанкреаса резко менялся от темно-коричневого до бледно-коричневого как у B. pellucida, так и у B. Similaris (рис. 3). Из-за изменения количества желтых пятен и окраски гепатопанкреаса взрослые и ювенильные особи двух видов стали неотличимы друг от друга по мягкотелой окраске под раковиной.
Под воздействием ультрафиолетового (УФА) излучения с длиной волны 360 нм все живые взрослые особи и молодые особи B.pellucida, собранные из природных местообитаний, излучали беловатую флуоресценцию, видимую человеческому глазу в темноте. При облучении УФ-А мягкого тела без панциря и листа спинной мантии, удаленного от тела, мы подтвердили, что только желтая часть спинной мантии излучает флуоресценцию. Желтые пигменты, обнаруженные со следами слизи на бумажном полотенце, также флуоресцировали даже после того, как бумажное полотенце и слизь высохли. Напротив, мы не обнаружили флуоресценции в мягких телах B.Similaris или B. pellucida, утративший желтый пигмент. Пустые раковины двух видов не проявляли ни желтого пигмента, ни флуоресценции. Ни один из 20 гибридов F 1 , выращенных в лаборатории, не приобрел желтый пигмент и не излучал флуоресценции.
Генитальная анатомия
Не было обнаружено различий в общей морфологии гениталий между B. pellucida и B. Similaris. Однако узоры микроскульптуры внутри пениальной трубки различались между двумя видами, хотя они мало различались у взрослых особей.Пениальная скульптура B. pellucida (рис. 4) характеризуется ромбовидными пустулами, разделенными прямыми тонкими бороздками и покрывающими более половины внутренней стенки от края семяпровода (верхний край на рис. 4). На краю несколько тонких неясных продольных пилястр. Некоторые из них частично зигзагообразные. Отдельные пустулы сливаются, образуя толстые продольные пилястры примерно на одной трети полового члена проксимальнее полового отверстия (нижний край на рис. 4).Продольные края этих пилястр слабозубчатые, но не разветвлены и не сращены друг с другом. Внутренняя пениальная поверхность B. Similaris (рис. 4) в основном покрыта пилястрами, идущими от края семявыводящего протока к половому отверстию. Эти пилястры различаются по ширине. В части, проксимальнее семявыносящего протока, пилястры тонкие, большей частью зубчатые и сжатые. На большей части внутренней поверхности полового члена пилястры разветвлены и в значительной степени зубчатые, сливаются в несколько крупных пилястр возле полового отверстия.
Рис. 4
Скульптура на внутренней стенке полового члена взрослой особи Bradybaena pellucida (слева), B. Similaris (справа) и их гибрида F 1 (в центре). Верхний край является краем семявыносящего протока, а нижний край продолжается до полового отверстия. Масштабная линейка, 1 мм.
Все 20 исследованных гибридов F 1 отличались от родительских видов пениальной скульптурой (рис. 4). Присутствовали пустулы неправильной формы с несколькими мелкозубчатыми пилястрами примерно на одной трети стенки полового члена рядом с семявыводящими протоками.Таким образом, площадь с пустулами у гибридов была меньше, чем у B. pellucida. Более половины площади внутренней стены, проксимальной к гениальному отверстию, было покрыто выступающими пилястрами. Эти пилястры были длиннее, чем у B. pellucida, и толще, менее разветвлены и менее зубчатые, чем у B. Similaris. Этот образец скульптуры полового члена у гибридов F 1 кажется промежуточным между таковыми у B. pellucida и B. Similaris.
Аллозимная вариация
Из 12 предполагаемых локусов, кодирующих 11 исследованных ферментов, шесть локусов из пяти ферментов были полиморфными в шести популяциях B.pellucida и B. Similaris (табл. 2). Два вида имеют наиболее распространенный аллель в двух локусах, Aat и Idh . Однако в других локусах частоты аллелей заметно различались между видами. На Cap Locus Cap Cap 80034 80034 был самым распространенным в B. Pellucida, тогда как Cap
или CAP или CAP
2 100 был наиболее частым в B. Anderis. В Mdh-I три популяции B.Similaris были зафиксированы для Mdh-I 100 , редко встречающегося у B. pellucida. Точно так же при Mdh-II три популяции B. Similaris были зафиксированы для Mdh-II 100 , в то время как три популяции B. pellucida были полиморфны по двум другим аллелям. Все три популяции B. pellucida были зафиксированы для Pgm 100 , а B. Similaris — для Pgm 45 .
Таблица 2
Частоты аллелей, гетерозиготность (H) и значения F ST для полиморфных аллозимных локусов в этом исследовании.
Средняя гетерозиготность составила 11% у B. Similaris и 20% у B. pellucida. Величина F ST не превышала 0,08 ни в одном локусе (табл. 2). Средние генетические расстояния (Nei, 1972) по 12 исследованным локусам составили 0,2384 между двумя видами и 0,0071 внутри вида (0,0064 для B. pellucida; 0,0077 для B. Similaris) (табл. 3).Разница между меж- и внутривидовыми генетическими дистанциями была статистически значимой (критерий Манна-Уитни, р=0,0014). Двадцать потомков F 1 , полученных от четырех межвидовых пар, были все гетерозиготными по Pgm 100 и Pgm 45 соответственно, для которых родительские популяции B.lucida, сходные с B. были зафиксированы, что указывает на то, что они были межвидовыми гибридами, а не результатом самоопыления.Таблица 3
ОБСУЖДЕНИЕ
Флуоресцентный пигмент мантии
Желтые пигменты просачиваются из мягкого тела в естественной среде обитания, а также в лаборатории. Таким образом, лабораторные условия не являются непосредственной причиной потери пигмента. Вместо этого лабораторные условия, вероятно, препятствовали восполнению пигмента, возможно, потому, что искусственная пища не обеспечивала необходимое вещество (вещества) для производства пигмента.Мелкая молодь B. pellucida в дикой природе вообще не имеет желтой окраски или проявляет ее слабо. Это говорит о том, что B. pellucida в дикой природе накапливает желтое вещество в виде пятен по мере своего роста.
Мы не обнаружили желтых пятен в мантии B. pellucida, потерявшей желтый цвет в лабораторных условиях. Вместо этого присутствовали редкие белые пятна, похожие на пятна B. Similaris. В середине лабораторного периода кормления оставшиеся желтые пятна B. pellucida мало менялись по цвету.Таким образом, желтые пятна не сменились белыми пятнами, а исчезли, а белые пятна B. pellucida, вероятно, присутствовали за плотными желтыми пятнами с начала опыта.
Различия в окраске мантии между двумя видами могут быть результатом различий в пище и/или микросреде обитания. Однако типы их местообитаний во многом пересекаются, и иногда они встречаются вместе. Тем не менее, при тщательном изучении ареала распространения в Японии не было обнаружено ни одного экземпляра с желтой окраской у B. Similaris (e.г., Комаи и Эмура, 1955; Асами и Охба, 1982). Это говорит о том, что пигмент мантии B. pellucida, зависящий от окружающей среды, является признаком генетического отличия от вида-близнеца, B. Similaris.
Нет сведений о подобных флуоресцентных метаболитах в других легочных, за исключением случая флуоресцентных пигментов, обнаруженных в слизи Cepaea nemoralis (L.) (J. Murray, личное сообщение). Хотя некоторые банановые слизни (род Ariolimax) известны своей ярко-желтой окраской (Gordon, 1994), неизвестно, зависят ли их цветовые вариации от окружающей среды в какой-либо степени.Слизень Arion fasciatus (Nilsson) терял желто-оранжевые пигменты мантии при выращивании на моркови, салате или бумаге, в то время как A. fasciatus и A. silvaticus Lohmander, выращенные на европейской крапиве Urtica dioica L., давали более сильную пигментацию, чем дикие особи ( Йорданс и др., 2001). В нашем предварительном эксперименте с кормлением морковь, салат или сладкий картофель не предотвращали потерю пигмента у взрослых или молодых B. pellucida, собранных в дикой природе, и не позволяли их потомству приобретать пигмент.Bradybaena pellucida часто встречается на японской крапиве Boehmeria nipononivea Koidz того же семейства (Urticaceae), что и европейская крапива.
В естественных и лабораторных условиях желтый пигмент просачивается со слизью из тела B. pellucida. Подобные примеры известны у слизней; Arion subfuscus (Draparnaud) и A. hortensis Férussac отличаются от других арионид выделением желто-оранжевой слизи (Kerney, Cameron, 1979), хотя неизвестно, теряют ли они окраску мантии в неволе.Arion fasciatus в естественных условиях имеет бесцветную слизь, но при выращивании на крапиве выделяет оранжевую слизь (Jordaens et al., 2001). Таким образом, данный случай не может быть уникальным для B. pellucida среди ракушечных легочных, и подобные примеры могли быть просто упущены из виду из-за традиционно предвзятого внимания к раковинам.
Несмотря на непрерывную потерю пигмента, B. pellucida накапливает пигмент, проявляя флуоресцентный желтый цвет и делая вид сверху заметным, по крайней мере, для человеческого глаза.В настоящее время неизвестно, есть ли какая-либо причина того, что флуоресценция и / или ярко-желтая спинная мантия обнажается через раковину. Изучение возможной функции пигмента требует дальнейших исследований экологии и эволюции B. pellucida. Химическая идентификация пигмента также необходима, чтобы понять, как он поступает из окружающей среды.
Пениальная скульптура
Принимая во внимание большое сходство двух видов в раковине и общей морфологии гениталий, а также в поведенческих и репродуктивных признаках, отраженное в успехе гибридизации, дискретное различие в сложной пениальной скульптуре между B.pellucida и B. Similaris. Наш результат показывает, что образцы скульптуры полового члена расходятся быстрее, чем другие морфологические признаки. Настоящее исследование показало, что гибриды F 1 демонстрируют пениальную анатомию, промежуточную между отличной микроскульптурой родительских видов. Таким образом, различия в скульптуре полового члена между двумя видами могут быть полигенными или определяться одним или несколькими генами, которые не проявляют полного доминирования.
Микроскульптура стенки полового члена часто используется для различения близкородственных видов легочных артерий (например,г., Эмбертон, 1991; Sutcharit и Panha, 2006). Это говорит о том, что скульптура полового члена развивается относительно быстро и, таким образом, может играть роль в физическом распознавании партнера при совокуплении, хотя этот аспект до сих пор привлекал мало внимания. Поскольку скульптура полового члена может функционировать только после обнажения полового члена (Asami et al., 1998), эволюционный сдвиг в скульптуре мог создать барьер для скрытой репродуктивной изоляции, возникающей в процессе совокупления, вместо посткопулятивного презиготического барьера. (Ховард, 1999).
Генетическое различие
Настоящее исследование аллозимов было направлено на генетическое различие двух видов и не ставило целью исчерпывающее изучение аллозимной изменчивости в пределах их ареалов. Наш аллозимный анализ показал, что генетическая дистанция в 12 исследованных локусах между B. pellucida и B. Similaris значительно больше, чем внутри обоих видов. Различия между видами были наиболее очевидны по локусам Pgm и Mdh-I . Внутри каждого вида F ST указывает, что различия между тремя популяциями составляли всего 8% от общей генетической изменчивости.Средняя гетерозиготность была немного выше у B. pellucida, чем у B. Similaris, потому что первый был изменчив в четырех локусах, а второй — в двух. Выяснение истории популяции с помощью исследований генетической изменчивости в достаточном количестве мест в более крупном географическом масштабе требует дальнейших исследований.
Наши результаты показывают, что B. pellucida и B. Similaris дают жизнеспособные гибриды F 1 , которые могут вырасти до зрелости без явного разрушения. Однако сила постзиготической изоляции должна быть определена количественно путем явной оценки приспособленности гибридов.Текущие результаты подчеркивают важность дальнейшего изучения интрогрессии и репродуктивной изоляции между двумя видами.
Благодарности
Мы благодарим Kurt Jordaens, Georg Armbruster, James Murray и Robert Cowie за комментарии, а также Masatoyo Okamoto, Hiroshi Fukuda, Kiyonori Tomiyama, Naoko Asami и Mao Asami за полевой сбор. Это исследование было частично поддержано JSPS Grants-in-Aid for Scientific Research для T.A.
ССЫЛКИ
1.
Т.Асами и Н. Асами . 2008. Механизм поддержания супергена полиморфизма окраски раковины у Bradybaena Similaris. Бастерия 72: 119–127. Google ученый2.
Т. Асами и С. Охба . 1982. Полиморфизм раковины наземной улитки Bradybaena Similaris в округе Канто. Научный представитель Takao Mus Nat Hist 11:13–28. Google ученый3.
Т. Асами и К. Обаяши . 1999. Влияние субстрата для откладки яиц на пожизненную плодовитость наземных легочных Bradybaena Similaris.Дж. Конхол 36: 1–9. Google ученый4.
Т. Асами, Х. Фукуда и К. Томияма . 1993. Наследование полосчатости раковины у наземной улитки Bradybaena pellucida. Венера 52: 155–159. Google ученый5.
Т. Асами, К. Обаяши и К. Секи . 1997а. Наследование окраски раковины у наземной улитки Bradybaena pellucida. Венера 56: 35–39. Google ученый6.
Т. Асами, Х. Ямасита, Дж. Парк и Х. Исикава . 1997б. Географическое распространение наземной улитки Bradybaena pellucida (Pulmonata: Bradybaenidae). Юриягай 5:31–42. Google ученый7.
Т. Асами, Р. Х. Коуи и К. Обаяши . 1998. Эволюция зеркальных изображений в результате сексуально асимметричного брачного поведения у улиток-гермафродитов. Ам Нат 152: 225–236. Google ученый8.
Эй Джей Кейн 1959. Наследование окраски мантии у Hygromia striolata (C. Pfeiffer). Дж. Конхол 24: 352–353. Google ученый9.
Эй Джей Кейн, П. М. Шеппард и Дж. М. Б. Кинг . 1968. Исследования Cepaea I. Генетика некоторых морф и разновидностей Capaea nemoralis (L.). Фил Транс Рой Сок Лонд Б. 253: 383–396. Google ученый10.
Р. Х. Коуи 1997.Каталог и библиография неместных неморских улиток и слизней Гавайских островов. Епископ Мус Оккас Пап 50: 1–66. Google ученый11.
К. Эмбертон 1991. Генитальная, аллозимная и конхологическая эволюция трибы Mesodontini (Pulmonata: Stylommatophora: Polygyridae). Малакология 33:71–178. Google ученый12.
A.E.J.P.J. Fd’A de Férussac 1821. 1822. Tableaux systématiques des animaux mollusques classés en familles naturelles, dans lesquels on a établi la concordance de tous les systèmes; suivis d’un prodrome générale pour tous les mollusques terrestres ou fluviatiles, vivants ou окаменелости.Бертран. Пэрис Сауэрби. Лондон. Google ученый13.
Д. Г. Гордон 1994. Полевой справочник Западного общества малакологов по слизням. Книги снежного человека. Сиэтл. Google ученый14.
Т. Хабе 1953. Наземные моллюски Сатаномисаки, самого южного острова Кюсю. Венера 17: 202–207. Google ученый15.
DJ Ховард 1999. Приоритет и видообразование конспецифических сперматозоидов и пыльцы.Энн Рев Экол Сист 30: 109–132. Google ученый16.
К. Йорданс, П. Ван Риэль, С. Гинен, Р. Верхаген и Т. Бакеляу . 2001. Пигментация тела, вызванная пищей, ставит под сомнение таксономическую ценность цвета самооплодотворяющихся слизней Carinarion spp. Дж. Молл Стад 67: 161–167. Google ученый17.
М. П. Керни и Р. А. Д. Кэмерон . 1979. Полевой справочник наземных улиток Великобритании и Северо-Западной Европы.Коллинз. Лондон. Google ученый18.
Т. Комай и С. Эмура . 1955. Исследование популяционной генетики полиморфной наземной улитки Bradybaena Similaris. Эволюция 9: 400–418. Google ученый19.
Дж. Мюррей 1963. Наследование некоторых признаков у Cepaea hortensis и Cepaea nemoralis (Gastropoda). Генетика 48: 605–615. Google ученый20.
Р.В. Мерфи, Дж. В. Сайтс-младший, Д. Г. Бут и CH Haufler . 1996. Белки: изоферментный электрофорез. В «Молекулярной систематике». Эд автор Д. М. Хиллис и К. Мориц , редакторы. Синауэр Ассошиэйтс. Сандерленд. стр. 96–116. Google ученый21.
М. Ней 1972. Генетическая дистанция между популяциями. Ам Нат 106: 283–292. Google ученый22.
С. Ранг 1831. Описание подвески des coquilles terrestres recueillies un voyage à la Côte occidentale d’Afrique, et au Brésil.Ann Sci Nat 24: 5–63. pl 3. Google Scholar23.
Х. Рейз 1997. Deroceras juranum — менделевская цветовая морфа D. rodnae (Gastropoda: Agriolimachidae). Дж. Зул 241: 103–115. Google ученый24.
К. С. Ричардс 1973. Варианты пигментации у Biomphalaria glabrata и других Planorbidae. Малакол Откр. 6:49–51. Google ученый25.
К. С. Ричардс 1978 год.Генетические исследования Biomphalaria straminea: появление четвертого аллеля гена, определяющего вариации пигментации. Малакология 17: 111–115. Google ученый26.
К. Секи, С. Иноуэ и Т. Асами . 2002. Географическое распространение родственных видов наземной улитки Bradybaena pellucida и B. Similaris на полуострове Босо. Венера 61: 41–48. Google ученый27.
Р. К. Селандер, М.Х. Смит, С. Ю. Ян, У. Э. Джонсон и Дж. Б. Джентри . 1971. Биохимический полиморфизм и систематика рода Peromyscus. I. Изменчивость полевой мыши (Peromiscus polionotus). Стад Жене 6: 49–90. Google ученый28.
Ч. Р. Шоу и Р. Прасад . 1970. Электрофорез ферментов в крахмальном геле — сборник рецептов. Биохим Гене 4: 297–320. Google ученый29.
С.Ф. Штум, Т. А. Пирс и А. Вальдес . 2006. Моллюски: руководство по их изучению, сбору и сохранению. Американское малакологическое общество. Питтсбург. Google ученый30.
К. Сутчарит и С. Панха . 2006. Таксономический обзор древесных улиток Amphidromus Albers, 1850 (Pulmonata: Camaenidae) в Таиланде и прилегающих районах: подрод Amphidromus. Дж. Моллус Стад 72: 1–30. Google ученый31.
С.Р. Верт 1985. Внедрение изоферментной лаборатории на полевой станции. Вирджиния J Sci 36: 53–76. Google ученый32.
М. Уильямсон 1959. Исследования окраски и генетики черного слизняка. Proc Roy Phys Soc Edinb 27:87–93. Google ученый33.
Х. Вольда 1969. Генетика полиморфизма наземной улитки Cepaea nemoralis. Генетика 40:475–502. Google ученыйПолногеномный анализ пресноводной улитки, передающей шистосомоз
Центр теоретической и эволюционной иммунологии, биология, Университет Нью-Мексико, Альбукерке, 87131, Нью-Мексико, США
Coen M.Адема, Эрик С. Локер, Сара К. Будденборг, Милинд Мисра, Джанет Дж. Пена и Си-Мин Чжан
Институт генома Макдоннелла, Вашингтонский университет, Сент-Луис, 63108, Миссури, США
ЛаДина В. Хиллер , Патрик Минкс, Сандра Клифтон, Катрина Фроник, Люсинда Фултон, Винс Магрини, Чад Томлинсон, Уэсли С. Уоррен и Ричард К. Уилсон
Институт биологических наук и наук об окружающей среде, Школа биологических наук, Абердинский университет, Тиллидрон-авеню , Абердин, AB24 2TZ, Великобритания
Кэтрин С.Jones & Leslie R. Noble
Отделение микробиологии, иммунологии и тропической медицины и Исследовательский центр забытых болезней бедности, Школа медицины и медицинских наук, Университет Джорджа Вашингтона, Вашингтон, 20037, округ Колумбия, США
Matty Knight & Ittiprasert Wannaporn
Отдел науки и математики, Университет округа Колумбия, 4200 Connecticut Avenue NW Washington, Washington, 20008, DC, USA
Matty Knight
René Rachou Research Center, FIOCRUZ-Minas Research Center, FIOCRUZ Белу-Оризонти, штат Массачусетс, Бразилия
Гильерме Оливейра, Джулиана Г.Ассис, Элио Хидео Баба, Йесид Куэста-Астроз, Сандра Г. Гава, Лиана К. Яннотти-Пассос, Вандер де Хесус Иеремиас, Фернанда Лудольф, Франсислон С. Оливейра, Фабиано С. Паис, Изинара К. Россе и Ларисса Л.С. Шольте
Институт технологий
Колледж последипломного образования Каролины Морская лаборатория Холлингса Чарлстон, Чарльстон, 29412, Южная Каролина, США
Эндрю Шедлок
Лаборатория биоинформатики и молекулярного анализа, Институт генетики и биохимии Федеральный университет Уберландии — Кампус Патос-де-Минас (UFU) , Патос-де-Минас, CEP 38700-128, Бразилия
Лоуренс Родригес-ду-Амарал и Матеус де Соуза Гомес
Департамент жизни e Sciences, Колледж здоровья и наук о жизни, Университет Брунеля, Лондон, UB8 3PH, Аксбридж, Великобритания
Halime D.Арикан-Гоктас и Джоанна М. Бриджер
Institut Sophia Agrobiotech, INRA/CNRS/UNS, София, Антиполис, Франция
Ольга Л. Барон и Кристин Кусто
Департамент интегративной биологии, Орегонский государственный университет, 30029 Cordley Hall, Corvallis, 97331, Орегон, США
Кристофер Дж. Бейн, Майкл Блуин и Джейкоб А. Теннессен
Факультет патобиологических наук, Университет Висконсина – Школа ветеринарной медицины, 2015 г. Линден д-р, Мэдисон, 53706, Висконсин, США
Утибе Бикхэм-Райт, Натали Дингирард, Сяо-Джун Ву и Тимоти П.Yoshino
Институт биохимии и факультет биологии Карлтонского университета, Оттава, Онтарио, Канада
Кайл К. Биггар и Кеннет Б. Стори
Университет штата Айова, Эймс, 00011 9005 Бори, США C. Bonning & Sijun Liu
Департамент информационных технологий, Гарвардская медицинская школа, 107 Avenue Louis Pasteur, Boston, 02115, Massachusetts, USA
Chris Botka
Департамент иммунологии, Центр медицинских наук Sunnybrook, Университет Торонто, 2075 Бэйвью-авеню, Rm.S126, Торонто, M4N 3M5, Онтарио, Канада
Кэтрин М. Бакли и Джонатан П. Раст
Laboratorio de Helmintologia e Malacologia Médica, FIOCRUZ-Minas, Исследовательский центр Рене Рашуде, Бразилия, Белу-Оризонти, Роберт
a Lima & Омар С. Карвальо
Департамент генетики человека. Университет Юты, 15 Север 2030 Восток, Солт-Лейк-Сити, 84112, Юта, США
Джулия Карлтон, Седрик Фешотт и Орели Капуста
Биология, Университет штата Нью-Мексико, Лас-Крусес, 88003, Нью-Мексико, США
Мария Г.Castillo & Cesar Montelongo
Тема исследований в области наук о животных и микробах, IBERS, Университет Аберистуита, Аберистуит, SY23 3FG, UK
Iain W. Chalmers, Katrin K. Geyer, Karl F. Hoffmann, 900 Umar Niaziwa555 90Martin Niaziwain
EMBL-EBI, Wellcome Genome Campus, CB10 1, UK
Mikkel Christensens, Daniel Hughes и Dan Lawson
Univ. Перпиньян Виа Домиция, IHPE UMR 5244, CNRS, IFREMER, Univ. Montpellier, Perpignan, F-66860, France
Celine Cosseau, David Duval, Richard Galinier, Benjamin Gourbal, Christoph Grunau, Guillaume Mitta & Titouan Quelais
Факультет биологии, Университет Нью-Мексико, 87131, Albuquerque , США
Ричард М.Криппс, Тайанна Л. Ловато, Кэтрин М. Райан и Дамиан Л. Трухильо
Факультет науки, здравоохранения и образования, Университет Саншайн-Кост, Маручидор, 4558, Квинсленд, Австралия
Скотт Ф. Камминс, Ди Лян , Yanin Limpanont, Bronwyn Rotgans, Tianfang Wang и Min Zhao
Институт медицинских исследований Уолтера и Элизы Холл 1G Royal Parade, Parkville, 3052, Виктория, Австралия
Леон ди Стефано и Энтони Т. Папенфус
9 0
5
5
5
5
5
5 Лаборатория биоинформатики и геномики рака Лоренцо и Памела Галли, научный сотрудник по исследованию меланомы Онкологический центр Питера Маккаллума Сент-Эндрюс-плейс, Восточный Мельбурн, 3002, Виктория, Австралия
Леон ди Стефано и Энтони Т.Papenfuss
Основной центр геномики и биоинформатики, 19 Galvin Life Sciences, Университет Нотр-Дам, Нотр-Дам, 46556, Индиана, США
Scott Emrich и Gloria I. Giraldo-Calderón
9000 Факультет наук об окружающей среде , Копенгагенский университет, Факультет естественных наук, Thorvaldsensvej 40, Frederiksberg C, 1871, Дания
Rene Feyereisen
Отдел анализа генома, Национальный институт рака, Национальные институты здравоохранения, Бетесда, 20892, Мэриленд, США
Peter FitzGerald
Биологические науки, Государственный университет Боулинг-Грин, Боулинг-Грин, 43403, Огайо, США
Майкл Гуз и Мишель А.Gordy
Департамент наук об общественном здравоохранении, Университет Альберты, 3-57F South Academic Building, Edmonton, T6G 1C9, Alberta, Canada
Патрик С. Ханингтон и Эммануэль А. Пила
Факультет биологии, Лоуренс Университет, Эпплтон, 54911, Висконсин, США
Джудит Хамфрис
Геобиологический исследовательский центр Куранта, Геттингенский университет Георга-Августа, Гольдшмидтштрассе 3, Геттинген, 37077, Германия
Джексон
Институт окружающей среды, здоровья и общества, Тема окружающей среды и здоровья, Университет Брунеля, Лондон, Аксбридж, UB8 3PH, Великобритания
Сьюзан Джоблинг, Сатвант Каур, Энн Э. Локьер и Эдвин Дж. Рутледж
Бишой Камель и Моника Медина
Faculteit der Aard-en Levenswetenschappen, Vrije Universiteit, De Boelelaan 1085-1087 1084 Joris 59 The Amsterdam HV000, Amsterdam HV000, Нидерланды
М.Koene
Лаборатория морской биологии Уитни, Университет Флориды, 9505 Ocean Shore Blvd, St Augustine, 32080, Флорида, США
Андреа Б. Кон и Леонид Л. Мороз
Лаборатория молекулярной паразитологии Медицинские науки Фармация и химия, Кингстонский университет, Кингстон-апон-Темз, Суррей, KT1 2EE, Великобритания
Скотт П. Лоутон и Энтони Дж. Уокер
Лаборатория молекулярной паразитологии, QIMR Медицинский исследовательский институт Бергхофера, Брисбен, 4006, Квинсленд, Австралия
Дональд П.McManus
Кенийский институт медицинских исследований, P.O. Коробка 54840, Найроби, 00200, Кения
Джеральд М. М.
Департамент нейробиологии, Пельманская школа медицины в Университете Пенсильвания, Филадельфия, 19104, Пенсильвания, США
Michael J. Montague
Экологические Отдел геномики и системной биологии, Беркли Биоинформатические проекты с открытым исходным кодом, Национальная лаборатория Лоуренса Беркли, One Cyclotron Road MS 977, Беркли, 94720, Калифорния, США
Моника С.Munoz-Torres
Факультет систем и вычислительной техники, Карлтонский университет, Оттава, Онтарио, Канада
Роб Пис
Институт геномики, Калифорнийский университет в Санта-Круз, Калифорнийский университет в Санта-Крус, Санта-Крус, 95064, Калифорния, США
Brian J. Raney
Отдел паразитов и переносчиков, Департамент наук о жизни, Лондонский центр исследований забытых тропических болезней, Биомедицинские лаборатории Wolfson Wellcome, Музей естественной истории, Cromwell Road, London, SW7 5BD, UK
David Rollinson
Департамент биомедицинских наук, Факультет науки и технологий, Вестминстерский университет, 115 New Cavendish Street, London, W1W 6UW, UK
Emanuela V.Volpi
Лондонский центр нанотехнологий, Университетский колледж Лондона, Gower Street, London, WC1E 6BT, UK
Mohammed Yusuf
Research Complex at Harwell, Rutherford Appleton Laboratory, Oxfordshire, OX11 0FA, UK
CMA, ESL, MK, NR задуманное исследование, научные цели. C.M.A. руководил подготовкой проекта и рукописи при участии членов руководящего комитета M.K., C.S.J., G.O., P.M., L.W.H., A.S., E.S.L., при содействии S.E. О.К. при условии полевых собранных улиток. C.M.A. и Э.С.Л. выращивали улиток и предоставили материалы. П.М., Л.В.Х., С.К., Л.Ф., В.К.В., Р.К.В., В.М., К.Т. разработал стратегию секвенирования, руководил проектом, провел сборку и оценку. Б.Р. выполнили выравнивание генома. MC, DH, SE, GG-C. и Д.Л. выполнял построение генома, управлял метаданными, выполнял аннотацию генома и анализ данных, а также способствовал аннотации сообщества с помощью M.C.M.-T. HDА.-Г., М.Ю., Е.В.В., М.К. и Дж.М.Б. провели кариотипирование и FISH-анализ. Я.А.Т. и М.Б. выполнено сопоставление связей. Г.О., Дж.Г.А., Ю.К.-А., С.Г.Г., Ф.Л. FSO, FSP, ICR и L.L.S.S. выполнили компьютерный анализ геномных, протеомных и транскриптомных данных, содержания SNP, секретома, метаболических путей и аннотации протеинкиназ эукариот (ePK). С.Ф.К., Л.Ю., Д.Л., М.З. и Д.МакМ. проводили исследования ферорецепции. М.Т.С., К.К.Г., У.Н. и К.Ф.Х. провели бактериальный симбионтный анализ.С.Л., С.-М.З., Э.С.Л. и B.C.B. сдали анализы на вирусы. М.К., П.Ф., В.И. и Н.Р. выполнил аннотацию HSP. Т.П.И., X.-J.W., У.Б.-W. и Н.Д. провели протеогеномные исследования эмбриональных (Bge) клеток B. glabrata и паразитореактивных белков-хозяев улитки, а также анализ данных. Р.Ф., А.Э.Л. и C.S.J. выполнил аннотацию CYP. Дж. Х. выполнил аннотацию NFkB. К.М.Б. и J.P.R. проведена аннотация консервативных иммунных факторов. C.M.A. и Дж.Дж.П. выполнил аннотацию FREP. М.К.и К.М. выполнена аннотация дополнения. Д.Д. выполнена аннотация апоптоза. Б.Г. и CJB выполнили аннотацию баланса REDOX. О.Л.Б., Д.Д., Р.Г., Ч.Ц. и Г.М. проведена аннотация антибактериальной защиты. Л.д.С. и А.Т.П. провели поиск генов антибактериальной защиты. П.Ч., М.А.Г. и Е.А.П. выполнил аннотацию неизвестных новых последовательностей. K.K.G., I.W.C., U.N., K.F.H., M.T.S., Ce.C., T.Q. и К.Г. выполнили аннотацию и анализ эпигенетических последовательностей. Э.Х.Б., Л.Р. делатьА., M.de.S.G., R.L.C. и W.de.J.J. выполнили аннотацию miRNA (Бразилия), K.K.B., R.P. и K.B.S. выполнили аннотацию микроРНК (Канада). М.Г. выполнена аннотация периодичности. SFC, B.R., T.W., A.E.L. и С.К. провели нейропептидные исследования и анализ данных. А.Э.Л., Р.Ф., С.К., Э.Дж.Р., С.Дж., Д.Р., К.С.Дж. и Л.Р.Н. выполнена аннотация стероидогенеза. Дж.М.К., Б.Р. и С.Ф.К. выполнена аннотация овипостатина. А.Б.К. и Л.Л.М. выполнен анализ локализации транскриптов в тканях. А.Дж.В.и С.П.Л. проведена аннотация фосфатаз. Т.Л.Л., К.М.Р., М.Ми. и Р.К. выполнили аннотацию актинов и аннотацию сердечной транскрипционной программы с помощью D.L.T. Д.Дж.Дж., Б.К. и М.Ме. проведена аннотация генов биоминерализации. Дж.К., А.К. и К.Ф. выполнили аннотацию транспозонов ДНК, глобальный анализ ландшафта мобильных элементов и событий горизонтального переноса. A.S. и CB выполнили повторный/TE-анализ. Э.С.Л., С.М.З., Г.М.М. и С.К.Б. провели сравнительные исследования транскриптома B. pfeifferi и анализ данных.C.M.A., написал большую часть текстов вместе с P.M., M.L.M. и вклады всех авторов.
CYMATIUM RANZANII — (Bianconi, 1850)
Cymatium ranzanii – вид хищных морских улиток, морских брюхоногих моллюсков семейства Ranellidae, улиток-тритонов, раковин тритонов или тритонов.
Синоним
Triton ranzanii (Bianconi, 1850)
Выдержка из «Новитате Американского музея — номер 2108 — 10.10.1962».
http://digitallibrary.amnh.org/dspace/bitstream/handle/2246/3407/N2108.pdf?sequence=1
Triton ranzanii был описан Бьянкони из «le canal de Mosambique» (1850, 1851a, 1851b, 1851c). Бьянкони сравнил свой вид с Triton femorale (Linne) из Вест-Индии. Последующие студенты группы лишь вскользь упомянули Triton ranzanii. Kiister и Kobelt (1878) рассмотрели Purpuracea и поместили этот таксон в список видов inquirendae. В монографии семейства Tritonidae Триона (1881, табл. 10, илл. 71) одна из фигур Бьянкони (Bianconi, 1851а; 1851б, илл.1) был воспроизведен, и этот таксон был включен в синоним Triton (Cymatium) tigrinus Broderip из тропической восточной части Тихого океана. Байер (1933) перечислил Cymatium (Cymatium) ranzanii как разновидность Cymatium (Cymatium) tigrinum (Broderip) в своем каталоге Cymatiidae в Рейкс-музее в Лейдене. Смит (1944, стр. 22, рис. 270) представил Триону репродукцию иллюстрации Бьянкони и вслед за Трионом отнес рисунок к Cymatium tigrinum (Broderip). Смит (1948) не упомянул Cymatium ranzanii в своем обзоре семейства Cymatiidae, а Франка (1960) не указала этот вид в своем списке моллюсков, собранных на острове Инхака, Мозамбик.Образцы этого вида, по-видимому, не были доступны этим рабочим, и валидность этого вида остается под вопросом до настоящего времени. Наш поиск образцов Cymatium ranzanii в конхологических коллекциях крупных музеев восточной части Соединенных Штатов показал следующее: один образец, по которому отсутствуют определенные данные о местонахождении, присутствует в старой коллекции Д. Дж. Стюарда Американского музея естественной истории; и единичные экземпляры были недавно получены Музеем сравнительной зоологии Гарвардского колледжа из Сомалиленда [Республика Сомали] и Национальным музеем США из близ Карачи, Пакистан.Недавно Американский музей естественной истории получил два фрагментарных экземпляра из Маската, Омана, Аравии. Эти пять экземпляров, по-видимому, являются единственными представителями этого вида, присутствующими в настоящее время в коллекциях этих учреждений, и все экземпляры, кроме одного, были получены в течение последних пяти лет. После определения редкости этого вида мы запросили дополнительную информацию у Гроша. Он любезно прислал нам на время еще два экземпляра и предоставил следующие полевые заметки: «Первый из немногих экземпляров, три собранных живыми и один или два мертвых, я нашел в марте или апреле 1953 года.Его размер составлял 204 мм. Еще один образец меньшего размера был обнаружен в 1957 году, а третий — в 1958 году. Все, включая один или два мертвых экземпляра, были обнаружены в одном и том же районе. Этот район находится в северо-восточном углу полуострова Кабасейра, который отделяет залив Мозамбик от залива Кондусия, примерно в 200 метрах от берега и примерно на 6-10 метров ниже уровня отлива. Район имеет террасированное гравийное дно, покрытое водорослями и усеянное крупными изолированными коралловыми валунами. Все образцы были собраны примерно во время мартовских весенних приливов между 1953-1959 годами.«По сравнению с известными ныне живущими видами Cymatium мало сомнений в том, что Cymatium ranzanii наиболее тесно связан с Cymatium tigrinum (Broderip) панамской фаунистической провинции и Cymatiumfemorale (Linne) карибской фауны (см. рис. 3, 4). Эти три вида образуют группу с очевидным сходством признаков раковины и относятся к Cymatium, sensu stricto. : Протеины моллюсков.Комптес Рендус Палевол. 2004, 3: 469-492. 10.1016/j.crpv.2004.07.009.
Артикул Google ученый
Wilt FH: Биология развития встречается с материаловедением: Морфогенез биоминерализованных структур. Дев биол. 2005, 280: 15-25. 10.1016/j.ydbio.2005.01.019.
КАС пабмед Статья Google ученый
Wilt FH, Killian CE, Livingston BT: Развитие известковых элементов скелета у беспозвоночных.Дифференциация. 2003, 71: 237-250. 10.1046/j.1432-0436.2003.7104501.х.
КАС пабмед Статья Google ученый
Jackson DJ, McDougall C, Green KM, Simpson F, Wörheide G, Degnan BM: Быстро развивающийся секретом строит и моделирует морскую раковину. БМС Биол. 2006, 4: 40-10.1186/1741-7007-4-40.
Центральный пабмед пабмед Статья Google ученый
Манн К., Эдсингер-Гонсалес Э., Манн М. Углубленный протеомный анализ раковины моллюска: кислоторастворимый и кислотонерастворимый матрикс блюдца Lottia gigantea .Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 10: 28-
CAS Google ученый
Marie B, Marie A, Jackson DJ, DuBost L, Degnan BM, Milet C, Marin F: Протеомный анализ кальцинированного органического матрикса тропического морского ушка Haliotis asinina shell. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010, 8: 54-
CAS Google ученый
Zhang G, Fang X, Guo X, Li L, Luo R, Xu F, Yang P, Zhang L, Wang X, Qi H, Xiong Z, Que H, Xie Y, Holland PWH, Paps J, Zhu Y, Wu F, Chen Y, Wang J, Peng C, Meng J, Yang L, Liu J, Wen B, Zhang N, Huang Z, Zhu Q, Feng Y, Mount A, Hedgecock D и др.: Геном устрицы выявляет стресс-адаптацию и сложность формирования раковин.Природа. 2012, 490: 49-54. 10.1038/природа11413.
КАС пабмед Статья Google ученый
Амос Ф.Ф., Понсе С.Б., Эванс Дж.С.: Формирование надмолекулярных сборок каркасных полипептидов перламутра, которые зародышеобразуют полиморфы. Биомакромолекулы. 2011, 12: 1883-1890. 10.1021/бм200231с.
КАС пабмед Статья Google ученый
Montagnani C, Marie B, Marin F, Belliard C, Riquet F, Tayalé A, Zanella-Cléon I, Fleury E, Gueguen Y, Piquemal D, Cochennec-Laureau N: Pmarg-pearlin представляет собой матричный белок, участвующий в Формирование каркаса перламутра у жемчужной устрицы Pinctada margaritifera.Химбиохим. 2011 г., doi:10.1002/cbic.201100216
Google ученый
Shen X, Belcher AMB, Hansma PK, Stucky GD, Morse DEM: Молекулярное клонирование и характеристика Lustrin A, матричного белка из раковины и жемчужного перламутра Haliotis rufescens . Дж. Биол. Хим. 1997, 272: 32472-32481. 10.1074/jbc.272.51.32472.
КАС пабмед Статья Google ученый
Suzuki M, Saruwatari K, Kogure T, Yamamoto Y, Nishimura T, Kato T, Nagasawa H: Белок кислого матрикса, Pif, является ключевой макромолекулой для образования перламутра.Наука. 2009, 325: 781-908.
Google ученый
Пават С., Занелла-Клеон И., Бекки М., Медакович Д., Люке Г., Гишар Н., Алькарас Г., Доммерг Ж.Л., Серпентини А., Лебель Ж.М.: Матрица раковины легочной наземной улитки Helix aspersa maxima . Comp Biochem Physiol B. 2012, 161: 303-314. 10.1016/j.cbpb.2011.12.003.
КАС пабмед Статья Google ученый
Fisher R, Diver C: Crossing-over in the Land Snail Cepea nemoralis , L.Природа. 1934, 133: 834-835.
Артикул Google ученый
Язык A: Fortgesetzte Vererbungsstudien. Мол Ген Жене. 1911, 5: 97-138. 10.1007/BF01798017.
Артикул Google ученый
Язык A: Vererbungswissenschaftliche Miszellen. Мол Ген Жене. 1912, 8: 233-283. 10.1007/BF01835489.
Артикул Google ученый
Каин А.Дж., Кинг Дж., Шеппард П.: Новые данные о генетике полиморфизма у улитки Cepaea nemoralis L.Генетика. 1960, 45: 393-411.
КАС ПабМед Центральный пабмед Google ученый
Кук Л. Генетика Cepaea nemoralis . Наследственность. 1967, 22: 397-410. 10.1038/hdy.1967.49.
Артикул Google ученый
Каин А.Дж., Шеппард П.М.: Естественный отбор в Cepaea . Генетика. 1954, 39: 89-116.
КАС ПабМед Центральный пабмед Google ученый
Сурмацкий А., Ожаровска-Новицка А., Канифоль З.М. Полиморфизм окраски наземной улитки Cepaea nemoralis (Pulmonata: Helicidae) глазами потенциальных хищников-птиц.Натурвиссеншафтен. 2013, 100: 1-8. 10.1007/s00114-012-1000-7.
Артикул Google ученый
Джонс Дж.С., Лейт Б., Роулингс П.: Полиморфизм в Cepaea : проблема со слишком большим количеством решений?. Annu Rev Ecol Syst. 1977, 8: 109-143. 10.1146/аннурев.эс.08.110177.000545.
Артикул Google ученый
Ричардс П.М., Лю М.М., Лоу Н., Дэйви Дж.В., Блакстер М.Л., Дэвисон А.: Маркеры, полученные с помощью RAD-Seq, обрамляют цвет раковины и локусы полос супергена Cepaea nemoralis .Мол Экол. 2013, 22: 3077-3089. 10.1111/меч.12262.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Comfort AC: Пигментация раковин моллюсков. Biol Rev. 1951, 26: 285-301.
КАС Статья Google ученый
Gysi JR, Chapman DJ: Сравнительная биохимия Haliotis пигментация: необычные билипептиды Haliotis cracherodii .Comp Biochem Physiol B. 1979, 63B: 355-361.
КАС Google ученый
Hedegaard C, Bardeau JF, Chateigner D: Пигменты раковин моллюсков: in situ резонансное рамановское исследование. J моллюск завод. 2006, 72: 157-162. 10.1093/моллюс/eyi062.
Артикул Google ученый
Koizumi C, Nonaka J: Желтые пигменты жемчуга — I. Каротиноидный пигмент в желтом перламутре.Bull Jap Soc Sci Fish. 1970, 36: 1054-1058. 10.2331/суисан.36.1054.
КАС Статья Google ученый
Рамос-Сильва П., Марин Ф., Каандорп Дж., Мари Б. Инструментарий биоминерализации: важность очистки образцов перед характеристикой биоминеральных протеомов. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013, 110: E2144-E2146. 10.1073/пнас.1303657110.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Дрейк Дж.Л., Масс Т., Харамати Л., Зелцион Э., Бхаттачарья Д., Фальковски П.Г.: Протеомный анализ скелетной органической матрицы каменистого коралла Stylophora pistillata .Proc Natl Acad Sci USA. 2013, 110: 3788-3793. 10.1073/пнас.1301419110.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Shur I, Socher R, Hameiri M, Fried A, Benayahu D: Молекулярная и клеточная характеристика SEL OB/SVEP1 в остеогенных клетках in vivo и in vitro. J Cell Physiol. 2006, 206: 420-427. 10.1002/jcp.20497.
КАС пабмед Статья Google ученый
Джексон Д.Дж., Макдугал С., Вудкрофт Б., Моас П., Роуз Р.А., Кубе М., Рейнхардт Р., Рохсар Д.С., Монтаньяни С., Жубер С., Пикемаль Д., Дегнан Б.М.: Параллельная эволюция наборов генов, образующих перламутр, у моллюсков.Мол Биол Эвол. 2010, 27: 591-608. 10.1093/молбев/msp278.
КАС пабмед Статья Google ученый
Marie B, Joubert C, Tayale A, Zanella-Cleon I, Belliard C, Piquemal D, Cochennec-Laureau N, Marin F, Gueguen Y, Montagnani C: различные секреторные репертуары контролируют процессы биоминерализации призмы и отложения перламутра раковины жемчужной устрицы. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 109: 20986-20991. 10.1073/пнас.1210552109.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Gaume B, Denis F, Van Wormhoudt A, Huchette S, Jackson DJ, Avignon S, Auzoux-Bordenave S: Характеристика и экспрессия биоминерализующего гена Lustrin A во время формирования раковины европейского морского ушка Haliotis tuberculata . Comp Biochem Physiol B. 2014, 169: 1-8.
КАС пабмед Статья Google ученый
Ранганатан С., Симпсон К.Дж., Шоу Д.К., Николас К.Р.: Семейство сывороточных кислых белков: новый характерный мотив и трехмерная структура путем сравнительного моделирования.Графовая модель J-Mol. 1999, 17: 106-113. 10.1016/S1093-3263(99)00023-6. 134
КАС пабмед Статья Google ученый
Мари Б., Джексон Д.Дж., Занелла-Клеон И., Рамос-Сильва П., Гишар Н., Марин Ф.: Протеом, образующий раковину Lottia gigantea , обнаруживает как глубокую консервацию, так и специфичные для линии новшества. ФЕБС Дж. 2013, 280: 214-232. 10.1111/февраль 12062.
КАС пабмед Статья Google ученый
Кабат А.Р.: Хищная экология натицидных брюхоногих моллюсков с обзором хищничества в раковинах.Мал Инт Джей Малак. 1990, 32: 155-193.
Google ученый
Касерес-Мартинес Дж., Масиас-Монтес-де-Ока П., Васкес-Йоманс Р.: Polydora sp. заражение и здоровье тихоокеанской устрицы Crassostrea gigas , выращенной в Нижней Калифорнии, на северо-западе Мексики. Дж Шелл Рез. 1998, 17: 259-264.
Google ученый
Le Cam S, Viard F: Заражение инвазивным моллюском Crepidula fornicata местным моллюском Cliona celata : случай высокой паразитарной нагрузки без пагубных последствий.Биол Инв. 2011, 13: 1087-1098. 10.1007/s10530-011-9958-1.
Артикул Google ученый
Herrmann H, Bär H, Kreplak L, Strelkov SV, Aebi U: Промежуточные филаменты: от клеточной архитектуры к наномеханике. Nat Rev Mol Cell Biol. 2007, 8: 562-573. 10.1038/nrm2197.
КАС пабмед Статья Google ученый
Qin Z, Kreplak L, Buehler MJ: Иерархическая структура контролирует наномеханические свойства промежуточных филаментов виментина.ПЛОС Один. 2009, 4: e7294-10.1371/journal.pone.0007294.
Центральный пабмед пабмед Статья Google ученый
Креплак Л., Фадж Д. Биомеханические свойства промежуточных филаментов: от тканей к одиночным филаментам и обратно. Биоэссе. 2007, 29: 26-35. 10.1002/бис.20514.
КАС пабмед Статья Google ученый
Марксен Дж. К., Нимц М., Беккер В., Манн К.: основные растворимые 19.Белок 6 кДа органического матрикса раковины пресноводной улитки Biomphalaria glabrata представляет собой N-гликозилированный дермапонтин. Биохим Биофиз Акта. 2003, 1650: 92-98. 10.1016/С1570-9639(03)00203-6.
КАС пабмед Статья Google ученый
Marxen JC, Becker W: Органическая матрица раковины пресноводной улитки Biomphalaria glabrata . Comp Biochem Physiol B. 1997, 118: 23-33.
Артикул Google ученый
Сарашина И., Ямагути Х., Хага Т., Иидзима М., Чиба С., Эндо К.: Молекулярная эволюция и функционально важные структуры дермапонтина моллюска: значение для происхождения белков матрикса оболочки моллюска.Дж Мол Эвол. 2006, 62: 307-318. 10.1007/s00239-005-0095-2.
КАС пабмед Статья Google ученый
Jiao Y, Wang H, Du X, Zhao X, Wang Q, Huang R, Deng Y: Дермапонтин, ген матриксного белка раковины Pearl Oyster Pinctada Martensii , участвует в формировании перламутра. Biochem Biophys Res Commun. 2012, 425: 679-683. 10.1016/j.bbrc.2012.07.099.
КАС пабмед Статья Google ученый
Финн Р.Д., Клементс Дж., Эдди С.Р.: Веб-сервер HMMER: интерактивный поиск сходства последовательностей.Нуклеиновые Кислоты Res. 2011, 39: W29-W37. 10.1093/нар/гкр367.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Ramos-Silva P, Kaandorp J, Huisman L, Marie B, Zanella-Cléon I, Guichard N, Miller DJ, Marin F: Скелетный протеом коралла Acropora millepora : эволюция кальцификации путем кооптации и перетасовка домена. Мол Биол Эвол. 2013
Google ученый
Манн К., Пустка А.Дж., Манн М.: Углубленная высокоточная протеомика матрицы зубов морского ежа.Proc Natl Acad Sci U S A. 2008, 6: 33-
Google ученый
Манн К., Пустка А.Дж., Манн М.: Тесты морского ежа ( Strongylocentrotus purpuratus ) и протеомы позвоночника. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008, 6: 22-
Google ученый
Петерс В.: Наличие хитина у моллюсков. Comp Biochem Physiol B. 1972, 41: 541-550.
КАС Google ученый
Weiss I, Schönitzer V, Eichner N, Sumper M: Хитинсинтаза, участвующая в формировании раковин морских двустворчатых моллюсков, содержит миозиновый домен.ФЭБС лат. 2006, 580: 1846-1852. 10.1016/j.febslet.2006.02.044.
КАС пабмед Статья Google ученый
Эрлих Х., Калужная О.В., Цуркан М.В., Ересковский А., Табачник К.Р., Илан М., Стеллинг А., Галли Р., Петрова О.В., Некипелов С.В.: Первое сообщение о хитиновой фиксации у губок (Porifera). Proc R Soc B. 2013, 280: 20130339-10.1098/rspb.2013.0339.
Центральный пабмед пабмед Статья Google ученый
Брюнет PCJ, Карлайл Д.Б.: Хитин у погонофор.Природа. 1958, 182: 1689-
КАС Статья Google ученый
Фалини Г., Фермани С.: Хитиновая минерализация. Ткань англ. 2004, 10: 1-6. 10.1089/1076327043227.
КАС пабмед Статья Google ученый
Takano Y, Ozawa H, Crenshaw MA: активность Ca-ATPase и ALPase в начальных участках кальцификации дентина и эмали в резце крысы.Сотовые Ткани Res. 1986, 243: 91-99.
КАС пабмед Статья Google ученый
Тамбутте Э., Аллеманд Д., Мюллер Э., Жобер Дж.: Детальный подход к изучению механизма кальцификации герматипных кораллов. J Эксперт Биол. 1996, 199: 1029-1041.
Google ученый
Roer RD: Механизмы резорбции и отложения кальция в панцире краба Carcinus Maenas .J Эксперт Биол. 1980, 88: 205-218.
КАС Google ученый
Миямото Х., Яно М., Мияшита Т. Сходства в структуре накреина, белка матрикса раковины, у двустворчатых моллюсков и брюхоногих моллюсков. J моллюск завод. 2003, 69: 87-89. 10.1093/моллюс/69.1.87.
Артикул Google ученый
Миямото Х., Мияшита Т., Окусима М., Накано С., Морита Т., Мацусиро А. Карбоангидраза из перламутрового слоя устричных жемчужин.Proc Natl Acad Sci U S A. 1996, 93: 9657-9660. 10.1073/пнас.93.18.9657.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Miyamoto H, Miyoshi F, Kohno J: Белок домена карбоангидразы накреин экспрессируется в эпителиальных клетках мантии и действует как негативный регулятор кальцификации у моллюска Pinctada fucata . Зоол науч. 2005, 22: 311-315. 10.2108/зсж.22.311.
КАС пабмед Статья Google ученый
Edgar RC: Поиск и кластеризация на несколько порядков быстрее, чем BLAST.Биоинформатика. 2010, 26: 2460-2461. 10.1093/биоинформатика/btq461.
КАС пабмед Статья Google ученый
Wisniewski JR, Zougman A, Nagaraj N, Mann M: Универсальный метод подготовки образцов для анализа протеома. Нат Мет. 2009, 6: 359-362. 10.1038/nmeth.1322.
КАС Статья Google ученый
Rappsilber J, Mann M, Ishihama Y: Протокол микроочистки, обогащения, предварительного фракционирования и хранения пептидов для протеомики с использованием StageTips.Нат Проток. 2007, 2: 1896-1906. 10.1038/нпрот.2007.261.
КАС пабмед Статья Google ученый
Михальски А., Дамок Э., Ланге О., Денисов Э., Нолтинг Д., Мюллер М., Винер Р., Шварц Дж., Ремес П., Белфорд М., Дуняч Дж.Дж., Кокс Дж., Хорнинг С., Манн М., Макаров А.: Ультра Масс-спектрометр Orbitrap с линейной ионной ловушкой высокого разрешения (Orbitrap Elite) позволяет использовать ЖХ-МС/МС сверху вниз и универсальные режимы фрагментации пептидов. Мол клеточная протеомика.2012, 11: О111.013698-10.1074/мкп.О111.013698.
Центральный пабмед пабмед Статья Google ученый
Schwanhausser B, Busse D, Li N, Dittmar G, Schuchhardt J, Wolf J, Chen W, Selbach M: Глобальная количественная оценка контроля экспрессии генов млекопитающих. Природа. 2011, 473: 337-342. 10.1038/природа10098.
ПабМед Статья Google ученый
Cox J, Mann M: MaxQuant обеспечивает высокую скорость идентификации пептидов, индивидуализированная с.Точность массы pb-диапазона и количественная оценка белка по всему протеому. Нац биотехнолог. 2008, 26: 1367-1372. 10.1038/нбт.1511.
КАС пабмед Статья Google ученый
Cox J, Matic I, Hilger M, Nagaraj N, Selbach M, Olsen JV, Mann M: Практическое руководство по вычислительной платформе MaxQuant для количественной протеомики на основе SILAC. Нат Проток. 2009, 4: 698-705. 10.1038/нпрот.2009.36.
КАС пабмед Статья Google ученый
Кокс Дж., Нойхаузер Н., Михальски А., Шелтема Р.А., Олсен Дж.В., Манн М.: Андромеда: поисковая система пептидов, интегрированная в среду MaxQuant.Дж Протеом Рез. 2011, 10: 1794-1805. 10.1021/пр101065ж.
КАС Статья Google ученый
Нойхаузер Н., Михальски А., Кокс Дж., Манн М.: Экспертная система для компьютерной аннотации спектров МС/МС. Мол клеточная протеомика. 2012, 11: 1500-1509. 10.1074/мкп.М112.020271.
Центральный пабмед пабмед Статья Google ученый
Goujon M, McWilliam H, Li W, Valentin F, Squizzato S, Paern J, Lopez R: Новая структура инструментов анализа биоинформатики в EMBL-EBI.Нуклеиновые Кислоты Res. 2010, 38: W695-W699. 10.1093/нар/gkq313.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Sievers F, Wilm A, Dineen D, Gibson TJ, Karplus K, Li W, Lopez R, McWilliam H, Remmert M, Soding J, Thompson JD, Higgins DG: Быстрое, масштабируемое производство высококачественных протеиновых множеств выравнивание последовательностей с использованием Clustal Omega. Мол Сист Биол. 2011, 7: 539-
PubMed Central пабмед Статья Google ученый
Хантер С., Джонс П., Митчелл А., Апвейлер Р., Эттвуд Т.К., Бейтман А., Бернард Т., Биннс Д., Борк П., Бердж С., де Кастро Э., Коггилл П., Корбетт М., Дас У., Догерти Л., Дюкенн Л., Финн Р.Д., Фрейзер М., Гоф Дж., Хафт Д., Хуло Н., Кан Д., Келли Э., Летуник И., Лонсдейл Д., Лопес Р., Мадера М., Маслен Дж., Маканулла С., МакДауэлл Дж. и др.: InterPro в 2011: новые разработки в базе данных прогнозирования семейств и доменов.Нуклеиновые Кислоты Res. 2012, 40: Д306-Д312. 10.1093/нар/гкр948.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
Petersen TN, Brunak S, von Heijne G, Nielsen H: SignalP 4.0: выделение сигнальных пептидов из трансмембранных областей. Нат Мет. 2011, 8 (10): 785-786. 10.1038/nmeth.1701.
КАС Статья Google ученый
Darzentas N: Circoletto: визуализация сходства последовательностей с Circos.Биоинформатика. 2010, 26: 2620-2621. 10.1093/биоинформатика/btq484.
КАС пабмед Статья Google ученый
Крживински М., Шейн Дж., Бироль И., Коннорс Дж., Гаскойн Р., Хорсман Д., Джонс С.Дж., Марра М.А.: Циркос: информационная эстетика для сравнительной геномики. Геном Res. 2009, 19: 1639-1645. 10.1101/гр.092759.109.
КАС ПабМед Центральный пабмед Статья Google ученый
(PDF) Экология популяции улитки Melampus bidentatus в изменяющихся ландшафтах солончаков
16 из 17
|
ZAJAC et Al.
Доннелли, Дж., и Бертнесс, М. (2001). Быстрое продвижение к берегу солончака
болотной травы в ответ на ускоренное повышение уровня моря. Proceedings
of the National Academy of Sciences, 98, 14218.
Fell, P., Murphy, K., Peck, M., & Recchia, M. (1991). Восстановление
Melampus bidentatus (Say) и других макробеспозвоночных на восстановленном
запруженном приливном болоте: сравнение популяций выше и ниже
дамбы водохранилища.Журнал экспериментальной морской биологии и экологии
, 152, 33–48.
Фелл П., Олмстед Н., Карлсон Э., Джейкоб В., Хичкок Д. и Силбер Г.
(1982). Распространение и численность макробеспозвоночных на некоторых приливных болотах Коннектикута с акцентом на доминирующих моллюсках.
Эстуарии и побережья, 5, 234–239.
Фелл П. и Уильямс Дж. (1985). Распределение улиток Melampus bidentatus
tus и мидий Geukensia demissa вдоль эстуария Патагуансет
(Коннектикут) в зависимости от солености и других беспозвоночных приливных болот.
The Nautilus (Филадельфия, Пенсильвания), 99, 21–28.
Фраско, Б.А., и Гуд, Р.Э. (1982). Динамика разложения Spartina
alterniflora и Spartina patens в солончаке Нью-Джерси. American
Журнал ботаники, 69, 402–406.
Гедан, К.Б., Альтьери, А.Х., и Бертнесс, М.Д. (2011). Неопределенное будущее
солончаков Новой Англии. Серия «Прогресс морской экологии», 434,
229–237.
Гедан, К., Силлиман, Б.и Бертнесс, М. (2009). Столетия антропогенных
изменений в экосистемах солончаков. Ежегодный обзор морской науки, 1,
117–141.
Граса, Массачусетс, Ньюэлл, С.Ю., и Кнайб, Р.Т. (2000). Скорость выедания органического вещества и биомассы живых грибов разлагающейся Spartina alterniflora
тремя видами солончаковых беспозвоночных. Морская биология, 136,
281–289.
Халупа, П.Дж., и Хоус, Б. (1995). Влияние влажности подстилки
на разложение Spartina alterniflora и S.патенты Морской пехотинец
Биология, 123, 379–391.
Хартиг, Э. К., Горниц, В., Колкер, А., Мушаке, Ф., и Фэллон, Д. (2002).
Антропогенное и климатическое воздействие на солончаки Ямайки
Бей, г. Нью-Йорк. Водно-болотные угодья, 22, 71–89.
Хаусман, С. (1932). Вклад в экологию солончака,
Melampus bidentatus Say. Американский натуралист, 66, 541–545.
Хитч А. Т., Перселл К. М., Мартин С.Б., Клеркс, П.Л., и Леберг, П.Л. (2011).
Взаимодействие засоления, фрагментации болот и затопленной водной
растительности на резидентных нектонных комплексах прибрежных болотных прудов.
Эстуарии и побережья, 34, 653–662.
Холдридж, К., Бертнесс, М., и Алтьери, А. (2009). Роль травоядных крабов в гибели солончаков Новой Англии. Биология сохранения, 23,
672–679.
Хьюз Р. и Парамор О. (2004).Об утрате солончаков на юго-востоке
Англии и методах их восстановления. Журнал прикладной экологии,
41, 440–448.
Хатченс, Дж. Дж. Младший, и Уолтерс, К. (2006). Численность и биомасса брюхоногих моллюсков
взаимосвязь с растительностью солончаков в южной части
эстуариев Каролины, США, где преобладает океан. Журнал исследований моллюсков, 25, 947–953.
Джойс, А., и Вайсберг, С. (1986). Последствия хищничества мумихога,
Fundulus heteroclitus (L.), по численности и распространению соляной
болотной улитки, Melampus bidentatus (Say). Journal of Experimental Marine
Biology and Ecology, 100, 295–306.
Кервин, Дж. (1972). Распространение солончака (Melampus bidentatus
Say) по отношению к болотным растениям в районе реки Поропотанк, Вирджиния.
Chesapeake Science, 13, 150–153.
Кирван М.Л., Гунтеншперген Г.Р., Д’Альпаос А., Моррис Дж.Т., Мадд С.М.,
и Теммерман С.(2010). Пределы приспособляемости прибрежных болот
к повышению уровня моря. Письма о геофизических исследованиях, 37, L23401.
Кирван, М.Л., и Мюррей, А.Б. (2008). Приливные болота как неравновесные ландшафты —
пейзажей? Лаги между морфологией и изменением уровня моря в голоцене.
Письма о геофизических исследованиях, 35, L24401.
Кирван, М.Л., Мюррей, А.Б., Доннелли, Дж.П., и Корбетт, Д.Р. (2011). Быстрое
расширение водно-болотных угодий во время европейского заселения и его последствия для
выживания болот при современных скоростях поступления наносов.Геологии, 39,
507–510.
Кирван, М., и Теммерман, С. (2009). Реакция прибрежных болот на историческое и будущее повышение уровня моря. Quaternary Science Reviews, 28,
1801–1808.
Ли, С., и Силлиман, Б. (2006). Конкурсное вытеснение детритоядной
солончаковой улитки. Журнал экспериментальной морской биологии и экологии, 339,
75–85.
Лук, Ю. К., и Заяц, Р. Н. (2013). Пространственная экология крабов-скрипачей, Uca pugnax,
в ландшафтах солончаков на юге Новой Англии: потенциальное расширение местообитаний
в связи с изменением солончаков.Северо-восточный натуралист, 20,
255–274.
МакМахон, Р., и Рассел-Хантер, В. (1981). Влияние физических факторов и акклиматизации на выживаемость и потребление кислорода высоко
прибрежной солончаковой улитки Melampus bidentatus Say. Биологический бюллетень,
161, 246–269.
Мюррей, А., Кнаапен, М., Тал, М., и Кирван, М. (2008). Биоморфодинамика:
физико-биологические обратные связи, формирующие ландшафты.Водные ресурсы
Research, 44, W11301.
Орсон, Р. А. (1999). Палеоэкологическая оценка Phragmites australis
в приливных болотах Новой Англии: изменения в структуре растительного сообщества
за последние несколько тысячелетий. Биологические вторжения, 1, 149–158. (2015). Повышение уровня моря и убежище для обитателей приливных болот: могут ли искусственные острова спасти железную дорогу Калифорнийского Риджуэя? Экологический
Машиностроение, 74, 337–344.
Прайс, К. (1980). Водные отношения и физиологическая экология солончака
Улитка Melampus bidentatus Say. Журнал экспериментальной морской биологии
и экологии, 45, 51–67.
Прайс, CH (1984). Приливные миграции литоральной солончаковой улитки Melampus
bidentatus Say. Журнал экспериментальной морской биологии и экологии, 78,
111–126.
Рапоза, К.Б., Вебер, Р.Л.Дж., Экберг, М.К., и Фергюсон, В. (2015).
Динамика растительности на солончаках Род-Айленда в период
ускоренного повышения уровня моря и экстремальных явлений, связанных с уровнем моря. Эстуарии и
Берега. doi:10.1007/s12237-015-0018-4
Рид, Д. Дж. (2006). Реакция прибрежных болот на повышение уровня моря:
выживание или затопление? Процессы и формы рельефа поверхности Земли, 20,
39–48.
Рейс С.Р. и Стивен А.Е. (1983). Мозаичность окружающей среды, разложение подстилки и связанная с этим структура фауны на болоте Spartina alterniflora.
Устье рек, прибрежная и шельфовая наука, 16, 559–571.
Риетсма, К.С., Валиела, И., и Буксбаум, Р. (1988). Химия детрита, рост
и выбор пищи у солончака (Melampus bidentatus).
Экология, 69, 261–266.
Риетсма, К., Валиела, И., и Сильвестр-Серианни, А. (1982). Пищевые предпочтения
доминирующих травоядных и детритофагов солончаков. Морская экология, 3,
179–189.
Розенберг, М.С. и Андерсон, CD (2011). ПРОХОД: Анализ закономерностей,
Пространственная статистика и географическая экзегеза. Версия 2. Методы
Экология и эволюция, 2, 229–232.
Рассел-Хантер, В., Эпли, М., и Хантер, Р. (1972). История ранней жизни
Мелампа и значение полулунной синхронии. The Biological
Bulletin, 143, 623.
Smith, SM (2009). Многолетние изменения в солончаках Кейп-Код,
Массачусетс: фотографический анализ утраты растительности, смены видов и геоморфологических изменений.Северо-восточный натуралист, 16, 183–208.
Смит, С. М. (2015a). Улучшает ли утрата солончаковой растительности, вызванная местным крабом-грапсидом
, пригодность среды обитания для атлантического грязевого скрипача (Uca
pugnax)? Журнал биологии ракообразных, 35, 616–621.
Смит, С. М. (2015b). Изменение растительности на солончаках Кейп-Код
National Seashore (Массачусетс, США) в период с 1984 по 2013 год.
Wetlands, 35, 127–136.
Смит, С. М., Медейрос, KC, и Tyrrell, MC (2012). Гидрология, травоядность и упадок Spartina patens (Aiton) Muhl. во внешнем Кейп-Код
Тканеспецифическая оценка подходящих эталонных генов для RT-qPCR у прудовика, Lymnaea stagnalis [PeerJ]
Фон
Lymnaea stagnalis — пресноводная улитка с обширной историей изучения непосредственных механизмов. Предыдущие исследования в основном были сосредоточены на его нейробиологии, а также эндокринологии, иммунологии и морфологии оболочки (Chase, 2002; Benjamin, 2008).Центральная нервная система (ЦНС) относительно проста и насчитывает около 20 000 нейронов, многие из которых крупные и легко идентифицируемые, что делает их подходящими для изучения обучения, памяти, генерации двигательных паттернов, регенерации нейронов и образования синапсов (Lukowiak, 2016; Elliott & Susswein, 2002; Chase, 2002; Lukowiak et al., 2003; Getz et al., 2018). Параллельные исследования нейроэндокринной (Koene, 2010; Pirger et al., 2010) и иммунной (Van Der Knaap, Adema & Sminia, 1993; Gust et al., 2013a) системы L. stagnalis и других брюхоногих моллюсков улучшили наше понимание репродуктивного поведения, иммунитета и токсикологии L. stagnalis . Кроме того, L. stagnalis использовался в качестве исследовательского организма для изучения молекулярных механизмов, управляющих формированием скорлупы (Boer & Witteveen, 1980; Ebanks, O’Donnell & Grosell, 2010; Hohagen & Jackson, 2013; Jackson, Herlitze & Hohagen, 2016; Herlitze et al., 2018). Совсем недавно л.stagnalis также использовался для изучения молекулярной основы асимметрии тела (Davison et al., 2016; Abe & Kuroda, 2019).
В прошлых исследованиях использовался широкий спектр традиционных методов, но современная молекулярная генетика еще не была полностью включена в изучение L. stagnalis . Методы изучения генетики L. stagnalis , такие как количественная ПЦР с обратной транскрипцией (RT-qPCR), гибридизация in situ и транскриптомика (среди прочего), были установлены, но еще не получили широкого применения (Feng et al., 2009; Херлитце и др., 2018). Несколько исследований с использованием RT-qPCR охватывают несколько тем, включая хиральность, обучение и память (Sadamoto et al., 2010; Foster, Lukowiak & Henry, 2015; Davison et al., 2016; Korneev et al., 2018; Dong et al. др., 2018). Кроме того, в небольшом количестве исследований использовалась гибридизация in situ у этого вида, в основном на срезах и целых препаратах ЦНС, а также на личинках (Dirks et al., 1989; Boer et al., 1992; Croll & Van Minnen, 1992; Садамото и др., 2004).Наша цель здесь состоит в том, чтобы продолжить создание основы для дальнейших исследований молекулярной генетики в L. stagnalis путем проверки генов-кандидатов эталонных для RT-qPCR.
RT-qPCR — это надежный метод количественного определения мРНК для определенного транскрипта. Его можно использовать вместе с гибридизацией in situ или другими методами визуализации для установления закономерностей экспрессии генов у животных. Для таких экспериментов относительная количественная оценка по одному или нескольким эталонным генам является наиболее распространенным выбором для сравнения экспрессии генов в образцах (Schmittgen & Livak, 2008; Ruijter et al., 2009). Исторически так сложилось, что высокоэкспрессированные клеточные поддерживающие гены были случайным образом выбраны в качестве эталонных генов для экспериментов qPCR у многих видов, поскольку считалось, что экспрессия таких генов по своей природе стабильна (Kozera & Rapacz, 2013). Однако было показано, что многие из этих генов имеют нестабильную экспрессию у некоторых видов растений и животных, что подчеркивает важность валидации для конкретных видов перед использованием (Dheda et al., 2004; Barber et al., 2005; De Jonge et al., 2005). и др., 2007; Тонг и др., 2009; Эйсса и др., 2016). Таким образом, проверка того, что эталонные гены-кандидаты имеют стабильную экспрессию, имеет решающее значение для получения точных данных количественной ПЦР и экспериментальных подходов, включающих этот метод.
Насколько нам известно, единственный предыдущий пример проверки эталонного гена в L. stagnalis относится к EF1α в ЦНС (Foster, Lukowiak & Henry, 2015). В других экспериментах использовались эталонные гены без проверки, включая фактора элонгации 1-альфа ( EF1α) (Gust et al., 2013б; Shimizu et al., 2013), глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа ( GAPDH ) (Aleksic & Feng, 2012), бета-актин ( ACTB ) (Senatore & Spafford, 2012; Hatakeyama et al. , 2013; Carter et al., 2015) и бета-тубулина ( TUBB ) (Bavan et al., 2012; Корнеев и др., 2013; Gust et al., 2013b; Flynn et al., 2014; Картер и др., 2015; Бенатти и др., 2017). Чтобы заложить более строгую основу для будущих исследований с использованием RT-qPCR, мы представляем анализ семи генов-кандидатов в шести представляющих интерес тканях (щупальца, губы, ступня, пенис, мантия и ЦНС) в L.стагналис . Мы также предоставляем комбинированный анализ данных из всех тканей, чтобы продемонстрировать, какие гены, вероятно, будут наиболее стабильно экспрессироваться в препаратах всего тела L. stagnalis .
Мы исследовали стабильность Lst-EF1 α, Lst-GAPDH , Lst-ACTB , Lst-TUBB и Lst-убиквитина ( UBI ), поскольку они обычно используются в качестве эталонных генов. Транскрипты матричной РНК, кодирующие пренилированный rab-акцепторный белок 1 ( Rapac1 ) и потенциалзависимый калиевый канал ( VGKC ), также были оценены как аналоги этих генов, недавно было обнаружено, что они стабильны у наземных брюхоногих моллюсков Cepaea nemoralis ( Аффенцеллер, Серво и Джексон, 2018 г.).
Методы
Уход за улитками
Использование животных соответствовало рекомендациям Канадского совета по уходу за животными. Колонию L. stagnalis выращивали и содержали в помещении для ухода за животными StFX. Животные подвергались воздействию фотопериода, соответствующего естественному дневному свету в Антигонише, Новая Шотландия. Воду в аквариумах с животными меняли три раза в неделю. Животных кормили кормом для рыб и салатом ромен вволю, а также тонущими белковыми гранулами один раз в неделю.
Тотальная экстракция РНК
Из каждой L. stagnalis интересующей ткани собиралитотальной РНК. Для подготовки к выделению РНК животных анестезировали 0,125% 1-фенокси-2-пропанолом, растворенным в физиологическом растворе Lymnaea , на срок до 30 мин (Wyeth et al., 2009). Животных препарировали для выделения шести представляющих интерес тканей: ЦНС, щупалец, губ, полового члена, стопы и мантии. Ткани каждого типа от двух животных объединяли для каждой повторности, чтобы обеспечить адекватный выход РНК из каждой ткани, с помощью этого метода получали три повторности.Ткани быстро замораживали в жидком азоте, измельчали лезвиями бритвы и добавляли к 500 мкл реагента TRIzol (Thermo Fisher, Waltham, MA, USA). Тканевые растворы тщательно гомогенизировали с помощью гомогенизатора тканей PowerGen 125 (Thermo Fisher, Уолтем, Массачусетс, США). Тотальную РНК выделяли из гомогенизированной ткани добавлением 0,5 объема раствора хлороформа и изоамилового спирта, 24:1. Водный слой отделяли и РНК осаждали изопропиловым спиртом. Осадок РНК переносили на спин-колонку E.З.Н.А. ® Mollusc RNA Kit (Omega Bio-Tek, Норкросс, Джорджия, США), где РНК промывали и подвергали обработке ДНКазой I на колонке в соответствии с инструкциями производителя. Для подтверждения эффективности обработки ДНКазой I была проведена ПЦР с наборами праймеров для Lst-тирозингидроксилазы (прямой: 5′-CCCACGTGTATCGTCATCTTA-3′; обратный: 5′-ATCTTCTCCTCGCAAAACC-3′) и Lst-EF1 . α с 20 нг общей РНК в качестве матрицы, так как эта реакция не будет работать в отсутствие загрязнения геномной ДНК (гДНК). Lst-тирозингидроксилаза была выбрана в качестве одного из средств контроля загрязнения гДНК, поскольку мы часто амплифицируем ее во всех интересующих тканях в рамках более крупного исследовательского проекта по развитию нервной системы. После 40 циклов амплификации ни одного гена не наблюдалось ни в одном из образцов РНК, поэтому образцы РНК были сочтены свободными от загрязнения гДНК.
Тотальной РНК количественно определяли на QuBit 3.0 (Thermo Fisher, Уолтем, Массачусетс, США). Выходы 50–200 нг/мкл, растворенные в 30 мкл воды молекулярной чистоты, были обычными для примерно 40 мг тканевой массы.Образец общей РНК измеряли с помощью спектрофотометра, чтобы подтвердить соотношение 260:280, равное 1,8–2,0. Наконец, пять мкл каждого образца РНК денатурировали в пяти мкл 2× красителя для загрузки РНК (New England Biolabs, Ипсвич, Массачусетс, США) при 75 °C в течение 10 минут, а затем немедленно помещали на лед. Образцы РНК загружали в 1% агарозный неденатурирующий гель и пропускали вместе с одноцепочечной РНК-лестницей (New England Biolabs, Ипсвич, Массачусетс, США), чтобы убедиться, что полосы 28S и 18S рРНК не повреждены, а образцы РНК не повреждены. деградировал.
ПЦР с обратной транскрипцией
Обратную транскрипцию-ПЦР проводили с помощью iScript Reverse Transcription Supermix для RT-qPCR (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния, США), которая содержит смесь олиго(dT) праймеров и случайных гексамеров. Для реакций ОТ-ПЦР 500 нг РНК добавляли к четырем мкл iScript Supermix и доводили до 20 мкл водой молекулярной чистоты в соответствии с рекомендациями производителя. ОТ-ПЦР проводили в термоциклере Bio-Rad CFX Connect (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния, США).Программа ОТ-ПЦР выполнялась при 25°С в течение 5 мин, 46°С в течение 20 мин и 95°С в течение 1 мин.
Разработка, проверка и оптимизация праймеров для количественной ПЦР
Праймеры-кандидаты, предназначенные для количественной ПЦР, были разработаны с помощью программного обеспечения CLC Main Workbench (Qiagen, Hilden, Germany). Праймеры были разработаны так, чтобы иметь длину 19–23 нуклеотида, температуру плавления от 55 до 62 ° C, содержание GC от 40% до 60% и давать продукт длиной не более 200 п.н. Кроме того, содержание GC в каждом праймере не превышало 10 % по сравнению с его аналогом, а температура плавления каждого из них поддерживалась в пределах 3 °C по сравнению с его аналогом.
Для каждого гена было разработано от двух до шести наборов праймеров, чтобы можно было выбрать оптимальные праймеры для реакций количественной ПЦР. Праймеры тестировали на комбинированных образцах кДНК, чтобы свести к минимуму тканеспецифическую погрешность. Были построены кривые плавления, чтобы убедиться, что один продукт амплифицируется. Если праймеры давали один продукт, то пять мкл ПЦР-реакций проводили на 2% (масса/объем) агарозном геле при 60 В в течение примерно 30 минут вместе с цепочкой ДНК 50 п.н. (New England BioLabs, Ипсвич, Массачусетс, США). Агарозные гели анализировали с помощью Bio-Rad ChemiDoc (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния, США) для визуализации размера продукта.В конце концов, для каждого референсного гена-кандидата был выбран один набор праймеров на основе качества продукта ПЦР. Праймеры для каждого референсного гена-кандидата перечислены в таблице 1.
Таблица 1:Описание всех праймеров, использованных для амплификации референсных генов-кандидатов в Lymnaea stagnalis .
Праймеры, помеченные «For», являются прямыми праймерами, а праймеры, помеченными «Rev», являются обратными праймерами, все последовательности написаны в направлении от 5′ к 3′. Эффективность амплификации определяли для каждого набора праймеров эталонного гена после RT-qPCR с пятью серийными разведениями 1:5 тотальной РНК из 100 нг.Ген | Последовательность праймеров (от 5′ до 3′) | Функция | Размер продукта (бп) | Тпл (°С) | Эффективность | р 2 | Присоединение |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Lst-ACTB | Для [AGGCCAACAGAGAAAAGA] Rev [AGATGCGTACAGAGAGAG] |
Структура клетки и подвижность | 97 | 56 | 2.12 | 0,999 | KX387883 |
Lst EF1α | Для [ACCACAACTGGCCACTTGATC] Rev [CCATCTCTTGGGCCTCTTTCT] |
Доставка тРНК для синтеза белка | 85 | 59 | 2,00 | 0,998 | МХ687364 |
Lst — ГАПДХ | Для [CAACAACCGACAAAGCAA] Ред. [CATAACAAACATAGGGGCA] |
Углеводный обмен | 93 | 55 | 1.82 | 0,988 | МХ687363 |
Lst — Rapac1 | Для [GGCTCTTTCTTTCCCTTTGT] Rev [TTCCTGCTCTTCTTGCGT] |
Сотовая торговля | 124 | 58 | 1,82 | 0,989 | МХ687365 |
Лст — ТУББ | Для [GGCTAGGGGATGAAGATGA] Rev [AGGATGAGGGTGAATTTGA] |
Элемент микротрубочек — клеточная структура | 130 | 56 | 1.80 | 0,993 | KX387887 |
Лст — УБИ | Для [GTATTGTGGTGCTGGTGTTTT] Rev [GCTTCCTCCTCTGGTTTGT] |
Регулирует функцию белка | 105 | 59 | 1,94 | 0,993 | МХ687367 |
Лст — ВГКЦ | Для [TGGCTTCCTGCTTCTCTGT] Rev [GCTTCTGTCGTTGTTTTTGCT] |
Поддержание потенциала клеточной мембраны | 99 | 60 | 1.82 | 0,997 | МХ687366 |
После выбора оптимальных наборов праймеров на основе специфичности реакции была рассчитана эффективность каждого набора праймеров. Кривые эффективности праймеров были получены из реакций RT-qPCR с серийными разведениями РНК. Исходная реакция содержала 100 нг общей РНК, и были выполнены четыре разведения 1:5 для получения пяти значений Cq.
Количественная ПЦР
При сборе данных количественной ПЦР соблюдались минимальные требования к публикации руководящих принципов проведения количественных экспериментов ПЦР в реальном времени (MIQE) (Bustin et al., 2009). Амплификация всех генов была обнаружена с помощью красителя SyBR Green, который генерирует флуоресценцию на основе синтеза двухцепочечной ДНК. Реакции содержали 2 мкл кДНК с 10 мкл Bio-Rad SsoAdvanced Universal SyBR Mix, концентрацию прямого и обратного праймеров 600 нМ и доводили до 20 мкл DEPC H 2 O. Каждый повтор тканей L. stagnalis был подвергали реакциям КПЦР в трех повторностях. Реакции количественной ПЦР проводились в термоциклере Bio-Rad CFX Connect с использованием специальной программы.Пользовательская программа qPCR состояла из 95 ° C в течение 30 с; 40 циклов: 95 °С в течение 15 с, 55 °С в течение 30 с. Планшет считывался машиной для измерения флуоресценции в конце каждого цикла.
Анализ данных
Стабильность экспрессии каждого гена оценивали с помощью четырех вычислительных алгоритмов: geNorm (Vandesompele et al., 2002), NormFinder (Andersen, Jensen & Ørntoft, 2004), BestKeeper (Pfaffl et al., 2004) и RefFinder (Xie et al., 2004). др., 2012). GeNorm ранжирует кандидатов по их значениям стабильности экспрессии ( M ), которые присваиваются после парных измерений вариаций между генами.Гены с M < 1,5 считаются стабильными. Алгоритм NormFinder сравнивает внутригрупповую изменчивость (т. е. уровни мРНК одного гена в интересующей ткани) с межгрупповой изменчивостью (т. е. уровни мРНК других генов в тех же тканях) и присваивает генам значение стабильности на основе вариации между Значения CQ. BestKeeper строит индекс стабильности на основе повторяющихся парных корреляционных анализов между каждым эталонным геном и оценивает стабильность эталонного гена на основе стандартного отклонения (SD) от индекса. BestKeeper оценивает гены с меньшим SD более высоко.Наконец, RefFinder использовался для объединения ранжированных результатов каждого алгоритма и присвоения каждому гену общего ранга.
Были проведены анализы данных для сравнения стабильности референсных генов-кандидатов в каждой интересующей ткани. После тканеспецифического анализа мы также объединили все данные для анализа, чтобы смоделировать условия анализа всего тела. Этот подход позволил определить, какие гены наиболее стабильны в каждой интересующей ткани, и предоставил доказательства того, какие гены будут наиболее сильными эталонными генами в эксперименте RT-qPCR, в котором использовалась РНК из целых л.стагналис кузов. Учитывая, что для надлежащей нормализации данных RT-qPCR обычно рекомендуется минимум два эталонных гена, рекомендуемые эталонные гены обычно выражаются парами.
Результаты
Специфичность и эффективность праймеров
Праймеры для всех референсных генов-кандидатов были оценены, чтобы убедиться, что они могут давать согласованные результаты и не амплифицировать нецелевые продукты или генерировать димеры праймеров. После амплификации каждая пара праймеров продуцировала ампликоны, которые давали одиночные полосы нужного размера после электрофореза в 2% агарозных гелях (рис.1). Кроме того, не наблюдалось амплификации в контрольных образцах, в которых отсутствовала обратная транскриптаза в ОТ-ПЦР или отсутствовала матрица кДНК или праймеры в количественном ПЦР. Таким образом, пары праймеров специфически амплифицируют одну кДНК-мишень. На основании стандартных кривых эффективность набора праймеров варьировалась от 90% ( GAPDH и Rapac1 ) до 106% ( ACTB ) с коэффициентами корреляции ( R 2 ) >0,980 (таблица 1).
Рисунок 1: Репрезентативное изображение продуктов ПЦР для каждого эталонного гена.
Пять мкл образца каждого продукта ПЦР анализировали на 2% агарозном геле, который также содержал контроль без праймера (NPC).Тканеспецифические профили экспрессии и стабильность эталонных генов
Референсные гены-кандидаты показали различные уровни экспрессии в отдельных тканях (рис. 2). Lst-UBI давал наименьшие средние значения Cq и отображал наименьшие диапазоны Cq для большинства тканей (таблица 2). Наоборот, мРНК Lst-VGKC была наименее распространена в каждой ткани и демонстрировала большие диапазоны Cq.
Рисунок 2: Уровни экспрессии для каждого гена в каждой ткани на основе Cq.
Данные собирали из трех повторностей ткани L. stagnalis , и каждую реакцию проводили в трех повторах. Исследуемые ткани: (A) ЦНС, (B) щупальца, (C) губы, (D) половой член, (E) ступня и (F) мантия. Блочная диаграмма: верхняя и нижняя границы прямоугольника обозначают 25-й и 75-й процентили, линия деления в прямоугольнике указывает медиану, а усы указывают минимальное/максимальное значения. Таблица 2:Средние значения Cq и стандартные ошибки среднего (SEM) эталонных генов для тканей в Lymnaea stagnalis .
Средние значения рассчитывали из трех повторов ткани L. stagnalis , каждую реакцию проводили в трех повторах.Lst-ACTB | Lst-EF1 α | Lst-GAPDH | Lst-Rapac1 | Лст-ТУББ | Лст-УБИ | Лст-ВГКЦ | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cq среднее | СЭМ | Cq означает | СЭМ | Cq означает | СЭМ | Cq означает | СЭМ | Cq означает | СЭМ | Cq означает | СЭМ | Cq означает | СЭМ | |
ЦНС | 19.27 | 0,67 | 19,49 | 0,53 | 21.10 | 0,56 | 26,81 | 0,81 | 18.30 | 0,76 | 16,72 | 0,20 | 29,27 | 0,82 |
Щупальца | 17,42 | 0,20 | 18.50 | 0,22 | 20.14 | 0,21 | 27,36 | 0,43 | 17,99 | 0,36 | 16.41 | 0,19 | 28,86 | 0,23 |
Губы | 18.19 | 0,27 | 19.14 | 0,23 | 21.01 | 0,21 | 26,97 | 0,19 | 18,39 | 0,29 | 17.11 | 0,27 | 29,26 | 0,28 |
Пенис | 18.30 | 0,38 | 17,87 | 0,25 | 19,71 | 0.25 | 26,44 | 0,35 | 22.05 | 1,98 | 16,55 | 0,16 | 30,60 | 0,23 |
Ножка | 18.08 | 0,41 | 18,91 | 0,48 | 20,22 | 0,46 | 25,72 | 0,46 | 18,53 | 0,25 | 16,69 | 0,24 | 30,48 | 0,17 |
Мантия | 17.67 | 0,26 | 18,91 | 0,24 | 20.41 | 0,34 | 27,57 | 0,39 | 22.16 | 0,42 | 16,24 | 0,16 | 30,78 | 0,31 |
Комбинезон | 18.15 | 0,17 | 18,80 | 0,15 | 20,43 | 0,16 | 26,81 | 0,20 | 19,57 | 0,43 | 16.62 | 0,09 | 29,87 | 0,19 |
Алгоритмы, использованные для измерения стабильности каждого референсного гена-кандидата, в высокой степени соответствовали их тканеспецифическим рейтингам. Поэтому на рис. 3 представлены только результаты анализа RefFinder (который объединяет рейтинги трех других алгоритмов) (результаты для других алгоритмов представлены на рис. S1–S3). Lst-GAPDH и Lst-EF1 α были наиболее стабильными референсными генами-кандидатами в ЦНС и половом члене. Lst-UBI и Lst-GAPDH были наиболее стабильны в щупальцах, Lst-GAPDH и Lst-Rapac1 были наиболее стабильны в губах, Lst-UBI и Lst-ACTB были наиболее стабильны в губах. наиболее устойчивы в стопе, а Lst-UBI и Lst-VGKC – в мантии. В целом, идентификация наиболее надежного референсного гена-кандидата зависела от ткани. Однако, согласно geNorm, все гены, за исключением Lst-ACTB и Lst-TUBB , были приемлемы в качестве эталонных генов для всех тканей, поскольку они соответствовали минимальному порогу стабильности M <1.50 для гетерогенных образцов ткани.
Рисунок 3: Рейтинг RefFinder для всех референсных генов-кандидатов по тканям.
Рейтинг RefFinder для (A) ЦНС, (B) щупалец, (C) губ, (D) полового члена, (E) стопы и (F) мантии. RefFinder вычисляет рейтинги как среднее геометрическое рейтингов, присвоенных geNorm, NormFinder и BestKeeper. Гены ранжированы в порядке от наименее стабильных к наиболее стабильным на каждой панели.Уровни экспрессии и стабильность эталонных генов в комбинированном анализе тканей
Чтобы оценить, какие референсные гены-кандидаты могут быть наиболее стабильными в препаратах всего тела L.stagnalis данные всех тканей были объединены и проанализированы вместе с geNorm, NormFinder, BestKeeper и RefFinder. Референсные гены-кандидаты охватывают широкий диапазон уровней экспрессии при объединении данных по всем типам тканей. Основываясь на значениях Cq, ген Lst-UBI был наиболее высоко экспрессированным геном (средний Cq 16,62 ± 0,09) и имел наименьший общий диапазон Cq, тогда как ген Lst-VGKC был наименее экспрессированным геном и имел самую высокую биологическую изменчивость по результатам измерений. по стандартной ошибке среднего (среднее Cq 29.87 ± 0,19; Таблица 2). Все четыре алгоритма, использованные для оценки стабильности экспрессии, в высокой степени соответствовали их ранжированию референсных генов-кандидатов в комбинированном анализе (рис. 4). GeNorm, NormFinder и RefFinder оценили Lst-GAPDH и Lst-EF1 α как два наиболее стабильных эталонных гена. BestKeeper оценил Lst-UBI как наиболее стабильный, а Lst-EF1 α и Lst-GAPDH как второй и третий по стабильности соответственно.
Рисунок 4: Рейтинги комбинированного анализа, присвоенные каждому референтному гену-кандидату.
Данные по всем тканям были объединены и ранжированы с помощью (A) geNorm, (B) NormFinder, (C) BestKeeper и (D) RefFinder. * Указывает, что оба гена были одинаково рекомендованы.Обсуждение
Мы использовали несколько установленных алгоритмов для анализа данных об изобилии мРНК и идентификации стабильно экспрессируемых генов, которые подходят в качестве эталонных генов для RT-qPCR в L. stagnalis . Мы оценили семь референсных генов-кандидатов ( Lst-ACTB , Lst-EF1 α, Lst-GAPDH , Lst-Rapac1 , Lst-TUBB , Lst-VC , G, в шести представляющих интерес тканях (ЦНС, щупальца, губы, пенис, ступня и мантия) и предоставили отдельный анализ всех объединенных тканей.Среди генов в разных тканях были разные модели стабильности экспрессии, но тканеспецифические рейтинги, полученные с помощью разных алгоритмов, были в высокой степени конгруэнтными. Lst-GAPDH и Lst-EF1 α были наиболее подходящей парой эталонных генов в ЦНС и половом члене. Однако Lst-UBI также был одним из двух наиболее стабильных генов щупалец, стопы и мантии в сочетании с Lst-GAPDH , Lst-ACTB и Lst-VGKC соответственно.Наконец, Lst-GAPDH и Lst-Rapac1 оказались наиболее стабильными в губах. В комбинированном анализе наиболее стабильными генами по всем алгоритмам оказались Lst-GAPDH , Lst-EF1 α и Lst-UBI . Таким образом, для будущих экспериментов с использованием целых животных или тканей или комбинаций тканей, не включенных в наш анализ, мы рекомендуем эти три гена в качестве первых кандидатов для проверки в качестве эталонных генов.
Предыдущие измерения стабильности эталонного гена RT-qPCR выявили некоторые устойчивые закономерности у моллюсков. EF1α , по-видимому, является наиболее эффективным эталонным геном у нескольких видов моллюсков в дополнение к ЦНС и половому члену L. stagnalis (таблица 3). В одном исследовании L. stagnalis , EF1α было установлено, что он остается стабильным в ЦНС при тепловом стрессе (Foster, Lukowiak & Henry, 2015). Учитывая, что EF1 α также был идентифицирован как высокостабильный у некоторых других моллюсков, он, по-видимому, является надежным референтным геном-кандидатом по всему типу (Morga et al., 2010; Ван и др., 2011; Куберо-Леон и др., 2012 г.; Маурис и др., 2012 г.; Морейра и др., 2014; Гарсия-Фернандес и др., 2016 г.; Хуан, Ван и Лю, 2016 г.). Анализ эталонных генов пресноводной улитки Bellamya aeruginosa показал, что EF1 α и GAPDH были стабильны в щупальцах и пенисе, но более изменчивы в стопе (Liu et al., 2015), как и наши результаты (Liu et al., 2015). хотя и с некоторыми расхождениями в ранжировании по щупальцам и стопе). Также было показано, что GAPDH является стабильным эталонным геном у двустворчатых моллюсков (Morga et al., 2010; Martínez-Escauriaza et al., 2018), но был признан непригодным для морских ушек и осьминогов (Wan et al., 2011; García-Fernández et al., 2016). Таким образом, GAPDH неодинаков для всех моллюсков. Кроме того, GAPDH обладает высокой стабильностью у наземных брюхоногих моллюсков C. nemoralis в течение определенного сезона, но уровни экспрессии у этого вида сильно различаются между сезонами (Affenzeller, Cerveau & Jackson, 2018). По нашим данным, Lst-UBI имел очень стабильный профиль экспрессии между тканями по сравнению с другими эталонными генами, и было обнаружено, что он очень стабилен в стопе, мантии и щупальцах, а также в комбинированном анализе. UBI также показал многообещающие результаты у других моллюсков (Sirakov et al., 2009; García-Fernández et al., 2016; Affenzeller, Cerveau & Jackson, 2018). Альфа-тубулин ( TUBA ) в целом дал положительные результаты в качестве эталонного гена у нескольких видов моллюсков (Sirakov et al., 2009; Cubero-Leon et al., 2012; Moreira et al., 2014). Однако TUBA был нестабилен в C. nemoralis (Affenzeller, Cerveau & Jackson, 2018), и мы также обнаружили, что Lst-TUBB крайне нестабилен. ACTB , как правило, давал отрицательные результаты в качестве референтного гена-кандидата у моллюсков (Cubero-Leon et al., 2012; Moreira et al., 2014; Liu et al., 2015; García-Fernández et al., 2016; Huan, Wang & Liu, 2016), и полученные здесь результаты для L. stagnalis в значительной степени совпадают с этими предыдущими выводами, хотя Lst-ACTB был стабильным именно в стопе. Наконец, Rapac1 и VGKC были идентифицированы как подходящие эталонные гены в C.nemoralis (Affenzeller, Cerveau & Jackson, 2018). Эти гены показали относительную стабильность в нашем анализе мантии и губ, но были относительно нестабильны в других исследованных тканях.
Таблица 3:Резюме рейтингов стабильности эталонных генов из исследований, проведенных на моллюсках.
Организм | Самый стабильный ген(ы) | Наименее стабильный ген(ы) | Другие протестированные гены | Артикул |
---|---|---|---|---|
Брюхоногие моллюски | ||||
Галиотис дискус | EF1 α/ RPL5 | 18S рРНК | ACTB , BGLU , CY , CY , GAPDH , HPRT , HPRT , SDHA , TUBB , UBC , CYP4 | Ван и др.(2011) |
Bellamya aeruginosa | РПЛ7 | АКТВ | 18S рРНК , EF1α , GAPDH , TUBB , h3A , DRP2 | Лю и др. (2016) |
Cepaea nemoralis | EF1α/ACTB | ГАПДХ | ДНАРП , ФИБ3 , ГТП8 , Рапак1 , РНКП , ТУБА , УБИ , ВГК4 | Аффенцеллер, Серво и Джексон (2018) |
Lymnaea stagnalis | EF1α/GAPDH | АКТБ/ТУББ | ВГКЦ , УБИ , Рапак1 | Настоящее исследование |
Головоногие | ||||
Осьминог обыкновенный | ТУБА/УБИ | 18S рРНК | 16S рРНК , ACTB , EF1α , TUBA | Сираков и др.(2009) |
Осьминог обыкновенный | УБИ | АКТВ | 18S рРНК , EF1α , GAPDH , TUBA | Гарсия-Фернандес и др. (2016) |
Двустворчатые моллюски | ||||
Ostrea edulis | EF1α/GAPDH | АКТВ | УБИ, РПЛ5 | Морга и др.(2010) |
Mytilus edulis | EF1α/18S рРНК | АКТВ | 28S рРНК , TUBA , HEL | Куберо-Леон и др. (2012) |
Mytilus galloprovincialis | EF1α | АКТВ | 18S рРНК , ТУБА | Морейра и др. (2014) |
Рудитапес филиппинарум | ТУБА | АКТВ | 18S рРНК , EF1α | Морейра и др.(2014) |
Crassostrea gigas | EF1α | РПС18 | АКТБ , АРФ1 , ГАПДХ , ХНРПК , УБК | Хуан, Ван и Лю (2016) |
Mytilus galloprovincialis | ГАПДХ/РПС4 | НАД4/18S рРНК | АКТБ , КОКС1 , ГАПДХ , РПС27 , ТИФ5А | Мартинес-Эскауриаза и др.(2018) |
Несмотря на неоднородность референсных генов высшего ранга в тканях, наблюдалась некоторая согласованность в стабильности экспрессии во всех тканях. Хотя Lst-EF1 α, Lst-GAPDH и Lst-UBI не были лучшими в каждой ткани по оценке RefFinder, они были относительно стабильны во всех протестированных тканях, что отражено в значениях стабильности, представленных генорм. Таким образом, мы рекомендуем эти гены для использования в сравнениях нескольких тканей у L.стагналис . В частности, Lst-EF1 α и Lst-GAPDH представляют собой благоприятную пару, так как имеют наиболее близкие диапазоны Cq. Важно отметить, что, несмотря на продемонстрированную здесь стабильность этих генов в исходных условиях, было бы крайне важно напрямую проверить их стабильность в любых экспериментальных условиях (Kozera & Rapacz, 2013).
Заключение
Валидация стабильных эталонных генов необходима для получения надежных данных об экспрессии генов.Поэтому важно выполнить видоспецифическую проверку стабильности эталонного гена перед проведением экспериментов RT-qPCR. Вариабельная экспрессия семи генов среди шести типов тканей, которые мы исследовали в L. stagnalis , демонстрирует, что очень важно выбирать эталонные гены на основе интересующих тканей. Представленные здесь результаты должны помочь в выборе эталонных генов для тканеспецифичной RT-qPCR и тем самым помочь в будущих исследованиях экспрессии генов у улиток.
Дополнительная информация
Рейтинги стабильностиGeNorm для всех референсных генов-кандидатов в каждой ткани.
гена ранжированы в порядке от наименее стабильного до двух наиболее стабильных.
DOI: 10.7717/peerj.7888/supp-1 Рейтинги стабильностиNormFinder для всех референсных генов-кандидатов в каждой ткани.
гена ранжированы в порядке от наименее стабильного к наиболее стабильному.
DOI: 10.7717/peerj.7888/supp-2рейтингов стабильности BestKeeper для всех эталонных кандидатов в каждой ткани.
гена ранжированы в порядке от наименее стабильного к наиболее стабильному.
DOI: 10.7717/peerj.7888/supp-3Необработанные значения Cq для всех реакций количественной ПЦР.
Реакции проводили в трех повторностях для каждого гена и каждой ткани. Для этого набора данных 500 нг РНК использовали в реакции обратной транскрипции перед количественной ПЦР.
DOI: 10.7717/peerj.7888/supp-4Все значения Cq для реакций количественной ПЦР.
Это дополнительный набор данных, не упомянутый в текущей версии статьи.Все необработанные значения Cq для каждой реакции количественной ПЦР. Реакции проводили в трех повторностях для каждого гена и каждой ткани. Для этого набора данных 20 нг РНК использовали в реакции обратной транскрипции перед количественной ПЦР.
DOI: 10.7717/peerj.7888/supp-5Пламя невежества и мудрость улитки
Сила улитки
После блуждания по инкубатору «Школы майяского продовольственного леса» в Чьяпасе в части I и наблюдения за сопротивлением первых народов юга Мексики могущественным корпоративным и правительственным силам, намеревающимся уничтожить их автономию и культуру в части II, мы заканчиваем взглядом. Назад к прошлому чудесному и постыдному и к будущему, вырезанному на раковине улитки.
«Рацион местных жителей до испанского завоевания состоял не только из кукурузы и бобов», — объясняет Пако Васкес, координатор Prodmedios, медиа-компании из Сан-Кристобаля, которая помогает местным сообществам по всей Мексике рассказывать свои собственные истории. с использованием самых разных средств массовой информации. Выросший на окраине того, что когда-то было столицей ацтеков, Пако является прямым потомком водных архитекторов науатль, которые построили плавучие сады и аквакультуру, которыми восхищались испанцы, а затем уничтожили.Пять веков превратили город, когда-то пронизанный чистыми каналами, в мегаполис, задыхающийся от дизельного топлива; так что Пако что-то знает об утерянных знаниях.
Ботаника майя. Детский шалфей – эффективный местный антисептик.
(Фото: Нэт Кригер)
«Астрономы майя рассчитали Большой взрыв, это их самое большое число. Они использовали основание 20; столькому испанцы могли бы поучиться. Майя также знали об устойчивости. Система энкомьенд уничтожила пищевые леса.Ограничившись одной усадьбой , у людей не осталось ни времени, ни сил даже на то, чтобы добраться до леса. Люди здесь доведены до нищеты колониальной системой, раньше они не были бедны».
Будь то порабощение и насильственное обращение при испанцах и их мексиканских преемниках, или ассимиляционные программы развития середины двадцатого века, направленные на исчезновение коренных народов в той или иной версии национальной культуры, большая материальная нищета всегда сопровождалась усилиями по деградации или уничтожить местные источники знаний и самоуважения.
«Люди, — вздыхает Армандо, — забыли о своих богатствах».
История усеяна преднамеренным уничтожением человеческих знаний: от сожжения, фактически сожжения библиотек Александрии до уничтожения Исламским государством 700-летних рукописей в Тимбукту; от ритуальных жертвоприношений Талмуда на улицах средневекового Парижа до зажигательных снарядов, выпущенных сербской националистической артиллерией, которые сожгли Сараевскую библиотеку изнутри. Заметное место в этом прискорбном списке занимает сожжение инквизицией тысяч кодексов майя, в том числе очень публичные костры, зажженные самим архиепископом.Если семь сохранившихся пьес Софокла напоминают нам о 116, которых у нас нет, то четыре кодекса майя, избежавшие огня, лишь заставляют нас удивляться знаниям — астрономическим, математическим, социальным и, да, ботаническим, — которых у нас никогда не будет. опять таки.
Народы майя, претендующие на свою культуру, языки и потоки знаний. Посторонний, пытающийся понять, насколько это революционно для Чьяпаса, должен сначала понять, как долго ладино (как в Чьяпасе традиционно называют более светлокожих, некоренных говорящих на испанском языке) думали и, следовательно, относились к майя штата. большинство как недочеловеки.
Поэт из Чьяпаса, писательница и феминистка Росарио Кастелланос запечатлела это отношение в своей ужасающей и вечной Книге Плача . Назначенный в Сан-Хуан-Чамула, цоцильскую деревню недалеко от Сан-Кристобаля, отец Мануэль смотрит на ризничего, человека, который заботился о маленькой церкви после смерти бывшего священника. Смотритель говорит на языке, которого священник не понимает, и имеет мировоззрение, которое падре не может понять:
«Каждое неуклюжее движение Ксо раздражало его.Индейский зверь, повторял он про себя, индейский зверь, жалкий индеец. И подумать только, что есть кто-то, кто хочет считать тебя человеком!»
Кадры из Чьяпаса из ее детства 1930-х годов, которые Кастелланос никогда не забывал: мужчины цоциль со стульями, привязанными к их спинам, несут ладино — детей и взрослых — по улицам Сан-Кристобаля. Иногда белые ездили на них в течение нескольких дней в загородные поместья в горах, и этот способ передвижения продолжался, по крайней мере, еще одно поколение.
«Я метис, но мне тоже пришлось сойти с тротуара», — добавляет Армандо. «Вплоть до 1970-х тротуары были для богатых».
«Как узнать, кто был богат?»
«Одежда и более светлая кожа».
Как и у многих уроженцев Чьяпаса, жизнь Армандо была построена на взаимодействии мира природы с миром машин, зова земли и возможностей в далеких городах. Сейчас ему 59 лет, он вырос в доме, наполненном звуками ткачества.В детстве Армандо помогал своим бабушке и дедушке с их 15 ткацкими станками и деревянными емкостями с краской. Он помнит, как женщины украшали свои черные юбки до щиколотки разноцветными полосками, которые обозначали их деревню. Для одной группы его бабушка и дедушка красили и пришивали толстую небесно-голубую полосу, опоясывающую низ юбки, а в другой деревне была более тонкая темно-синяя полоса.
Первой любовью Армандо были растения, семейное поле было всего в полукилометре от него, но рано он понял, что умеет обращаться с машинами.Когда он был еще маленьким, Армандо собрал небольшую четырехколесную повозку, на которую он свалил влажную золу, которая использовалась в качестве ингредиента в процессе производства красок, а затем разбрасывал ее по семейному полю в качестве удобрения. Его carreta было большим улучшением по сравнению с двумя тяжелыми сумками, наполненными промокшими вещами, привязанными к концам шеста, балансирующего на его плечах и шее!
В молодости Армандо отправился в Мехико, где прошел обучение на GM. механиком, позже вернувшись домой в Чьяпас, чтобы обучать ремеслу молодых людей.(Другие источники добавляют, что, как и старые деревенские врачи, Армандо вернул множество транспортных средств с грани смерти по всей стране сапатистов).
Два года назад Арман решил посвятить все свое время лесу с едой. «Я отверг свою вторую любовь, — говорит он с легким смехом.
Кажется, он не жалеет об этом. Вы слышите его любовь к земле в его увлечении окружающими его растениями, вы видите это в том, как его руки держат и просеивают почву, как он останавливается на полуслове, чтобы проследить крылатую формацию.
Caracol в переводе с испанского означает улитка. Сапатисты выбрали это животное в качестве названия для своих автономных зон, потому что, по словам Армандо, «улитка медленная, но устойчивая». Улитка символизирует сообщество, а также настойчивость — когда улитки получают шанс, они всегда предпочитают быть вместе. Питание мокрыми листьями, грибками и даже грязевыми улитками является важным звеном в естественной цепи разложения. Питая как почву, так и хищников кальцием выживших раковин, эти моллюски обычно изображаются в нижней части пищевой цепи, намного ниже орла или змеи, двух национальных тотемов У.С. и Мексика.
Медленная, но неуклонная улитка несет один мир, в котором много миров
(Фото: Нэт Кригер)
Как и растения, улитки живут как на земле, так и в ней. Оболочка, которую они несут, украшена золотым сечением, спиралью, которая формирует подсолнухи, ураганы, закручивающуюся волну и нашу галактику. Молодые листья кукурузы и человеческие отпечатки пальцев также имеют ту же спиральную структуру. Почти как улитки — это медленно движущиеся рекламные щиты, рекламирующие на языке космической геометрии, который мы слишком «развиты», чтобы понять.
Сапатисты отвернулись от вооруженной борьбы к более тяжелым, медленным, но более устойчивым усилиям по построению более справедливого общества, всегда начиная с изучения самих себя и своих собственных взглядов. В отличие от многих прошлых революционных сражений, методы соответствуют целям, на самом деле они неразделимы.
Задержитесь слишком долго в нашем круглосуточно работающем СМИ развлекательном центре эгоизма, эксгибиционизма и демонстративной жестокости, и станет трудно вспомнить, не говоря уже о том, чтобы услышать, сообщения о достоинстве и настойчивости.Но выйдите наружу, в сумерки, и почувствуйте их под ногами, услышите, как их несет ветер. Мы могли бы сделать хуже, чем слушать.
Для тех, кто хочет помочь проекту Food Forest или узнать о других программах, спонсируемых Schools for Chiapas, перейдите по ссылкам здесь и здесь.
[Обновлено 2108-07-18] Сразу после того, как этот репортер уехал из Чьяпаса, Армандо, который так много сделал для запуска программы продовольственных лесов, перенес обширный инсульт. Читатели, желающие помочь, могут перейти на страницу GoFundMe или на эту страницу в Facebook .
Нэт Кригер
Нэт Кригер работает в Объединенном Сан-Диего, где в хорошие дни он чинит компьютеры.